Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE6

Asf1a, Histone chaperone ASF1A, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1aQ9CQE6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Asf1aQ9CQE6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Asf1aQ9CQE6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Asf1aQ9CQE6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Asf1aQ9CQE6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Asf1aQ9CQE6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Asf1aQ9CQE6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Asf1aQ9CQE6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Asf1aQ9CQE6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Asf1aQ9CQE6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Asf1aQ9CQE6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Asf1aQ9CQE6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Asf1aQ9CQE6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Asf1aQ9CQE6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Asf1aQ9CQE6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Asf1aQ9CQE6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Asf1aQ9CQE6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Asf1aQ9CQE6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Asf1aQ9CQE6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Asf1aQ9CQE6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Asf1aQ9CQE6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Asf1aQ9CQE6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Asf1aQ9CQE6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Asf1aQ9CQE6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Asf1aQ9CQE6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Asf1aQ9CQE6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Asf1aQ9CQE6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Asf1aQ9CQE6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Asf1aQ9CQE6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Asf1aQ9CQE6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Asf1aQ9CQE6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Asf1aQ9CQE6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Asf1aQ9CQE6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Asf1aQ9CQE6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Asf1aQ9CQE6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Asf1aQ9CQE6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Asf1aQ9CQE6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Asf1aQ9CQE6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Asf1aQ9CQE6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Asf1aQ9CQE6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Asf1aQ9CQE6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Asf1aQ9CQE6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Asf1aQ9CQE6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Asf1aQ9CQE6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Asf1aQ9CQE6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Asf1aQ9CQE6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Asf1aQ9CQE6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Asf1aQ9CQE6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Asf1aQ9CQE6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Asf1aQ9CQE6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Asf1aQ9CQE6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Asf1aQ9CQE6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Asf1aQ9CQE6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Asf1aQ9CQE6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Asf1aQ9CQE6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Asf1aQ9CQE6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Asf1aQ9CQE6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Asf1aQ9CQE6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Asf1aQ9CQE6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Asf1aQ9CQE6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Asf1aQ9CQE6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Asf1aQ9CQE6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Asf1aQ9CQE6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Asf1aQ9CQE6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Asf1aQ9CQE6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Asf1aQ9CQE6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Asf1aQ9CQE6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Asf1aQ9CQE6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Asf1aQ9CQE6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Asf1aQ9CQE6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Asf1aQ9CQE6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Asf1aQ9CQE6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Asf1aQ9CQE6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Asf1aQ9CQE6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Asf1aQ9CQE6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Asf1aQ9CQE6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Asf1aQ9CQE6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Asf1aQ9CQE6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Asf1aQ9CQE6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Asf1aQ9CQE6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Asf1aQ9CQE6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Asf1aQ9CQE6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Asf1aQ9CQE6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Asf1aQ9CQE6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Asf1aQ9CQE6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Asf1aQ9CQE6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Asf1aQ9CQE6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Asf1aQ9CQE6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Asf1aQ9CQE6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Asf1aQ9CQE6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Asf1aQ9CQE6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Asf1aQ9CQE6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Asf1aQ9CQE6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Asf1aQ9CQE6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Asf1aQ9CQE6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Asf1aQ9CQE6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Asf1aQ9CQE6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Asf1aQ9CQE6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Asf1aQ9CQE6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Asf1aQ9CQE6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms