Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms