Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR1

Rwdd4, RWD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd4Q9CPR1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rwdd4Q9CPR1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rwdd4Q9CPR1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rwdd4Q9CPR1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rwdd4Q9CPR1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rwdd4Q9CPR1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rwdd4Q9CPR1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rwdd4Q9CPR1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rwdd4Q9CPR1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rwdd4Q9CPR1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rwdd4Q9CPR1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rwdd4Q9CPR1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rwdd4Q9CPR1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rwdd4Q9CPR1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rwdd4Q9CPR1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rwdd4Q9CPR1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rwdd4Q9CPR1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rwdd4Q9CPR1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rwdd4Q9CPR1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rwdd4Q9CPR1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rwdd4Q9CPR1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rwdd4Q9CPR1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rwdd4Q9CPR1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rwdd4Q9CPR1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rwdd4Q9CPR1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rwdd4Q9CPR1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rwdd4Q9CPR1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rwdd4Q9CPR1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rwdd4Q9CPR1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rwdd4Q9CPR1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rwdd4Q9CPR1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rwdd4Q9CPR1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rwdd4Q9CPR1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rwdd4Q9CPR1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rwdd4Q9CPR1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rwdd4Q9CPR1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rwdd4Q9CPR1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rwdd4Q9CPR1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rwdd4Q9CPR1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rwdd4Q9CPR1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rwdd4Q9CPR1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rwdd4Q9CPR1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rwdd4Q9CPR1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rwdd4Q9CPR1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rwdd4Q9CPR1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rwdd4Q9CPR1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rwdd4Q9CPR1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rwdd4Q9CPR1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rwdd4Q9CPR1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rwdd4Q9CPR1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rwdd4Q9CPR1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rwdd4Q9CPR1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rwdd4Q9CPR1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rwdd4Q9CPR1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rwdd4Q9CPR1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rwdd4Q9CPR1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rwdd4Q9CPR1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rwdd4Q9CPR1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rwdd4Q9CPR1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rwdd4Q9CPR1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rwdd4Q9CPR1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rwdd4Q9CPR1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rwdd4Q9CPR1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rwdd4Q9CPR1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rwdd4Q9CPR1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rwdd4Q9CPR1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rwdd4Q9CPR1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rwdd4Q9CPR1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rwdd4Q9CPR1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rwdd4Q9CPR1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rwdd4Q9CPR1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rwdd4Q9CPR1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rwdd4Q9CPR1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rwdd4Q9CPR1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rwdd4Q9CPR1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rwdd4Q9CPR1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rwdd4Q9CPR1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rwdd4Q9CPR1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rwdd4Q9CPR1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rwdd4Q9CPR1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rwdd4Q9CPR1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rwdd4Q9CPR1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rwdd4Q9CPR1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rwdd4Q9CPR1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rwdd4Q9CPR1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rwdd4Q9CPR1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rwdd4Q9CPR1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rwdd4Q9CPR1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rwdd4Q9CPR1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rwdd4Q9CPR1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rwdd4Q9CPR1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rwdd4Q9CPR1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rwdd4Q9CPR1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rwdd4Q9CPR1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rwdd4Q9CPR1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rwdd4Q9CPR1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rwdd4Q9CPR1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rwdd4Q9CPR1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rwdd4Q9CPR1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rwdd4Q9CPR1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms