Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf8Q99PV0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf8Q99PV0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf8Q99PV0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf8Q99PV0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf8Q99PV0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf8Q99PV0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf8Q99PV0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf8Q99PV0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf8Q99PV0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf8Q99PV0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf8Q99PV0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf8Q99PV0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf8Q99PV0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf8Q99PV0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prpf8Q99PV0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prpf8Q99PV0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prpf8Q99PV0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prpf8Q99PV0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prpf8Q99PV0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prpf8Q99PV0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Prpf8Q99PV0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf8Q99PV0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf8Q99PV0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf8Q99PV0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf8Q99PV0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf8Q99PV0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf8Q99PV0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf8Q99PV0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf8Q99PV0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf8Q99PV0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf8Q99PV0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf8Q99PV0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf8Q99PV0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf8Q99PV0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf8Q99PV0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf8Q99PV0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf8Q99PV0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf8Q99PV0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf8Q99PV0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf8Q99PV0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf8Q99PV0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf8Q99PV0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf8Q99PV0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf8Q99PV0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf8Q99PV0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf8Q99PV0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf8Q99PV0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf8Q99PV0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf8Q99PV0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf8Q99PV0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf8Q99PV0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf8Q99PV0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf8Q99PV0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf8Q99PV0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf8Q99PV0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf8Q99PV0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf8Q99PV0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf8Q99PV0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf8Q99PV0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf8Q99PV0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf8Q99PV0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf8Q99PV0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf8Q99PV0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf8Q99PV0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf8Q99PV0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf8Q99PV0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf8Q99PV0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf8Q99PV0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf8Q99PV0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf8Q99PV0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf8Q99PV0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf8Q99PV0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf8Q99PV0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf8Q99PV0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf8Q99PV0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf8Q99PV0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf8Q99PV0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf8Q99PV0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf8Q99PV0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf8Q99PV0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf8Q99PV0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf8Q99PV0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf8Q99PV0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf8Q99PV0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf8Q99PV0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prpf8Q99PV0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prpf8Q99PV0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prpf8Q99PV0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prpf8Q99PV0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Prpf8Q99PV0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prpf8Q99PV0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prpf8Q99PV0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prpf8Q99PV0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prpf8Q99PV0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prpf8Q99PV0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prpf8Q99PV0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prpf8Q99PV0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prpf8Q99PV0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prpf8Q99PV0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms