Protein–RNA interactions for Protein: Q99PU7

Bap1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap1Q99PU7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Bap1Q99PU7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Bap1Q99PU7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Bap1Q99PU7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Bap1Q99PU7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Bap1Q99PU7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Bap1Q99PU7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Bap1Q99PU7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Bap1Q99PU7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Bap1Q99PU7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Bap1Q99PU7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Bap1Q99PU7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Bap1Q99PU7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Bap1Q99PU7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Bap1Q99PU7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Bap1Q99PU7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Bap1Q99PU7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Bap1Q99PU7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Bap1Q99PU7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Bap1Q99PU7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Bap1Q99PU7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Bap1Q99PU7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Bap1Q99PU7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Bap1Q99PU7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Bap1Q99PU7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Bap1Q99PU7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Bap1Q99PU7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Bap1Q99PU7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Bap1Q99PU7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Bap1Q99PU7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Bap1Q99PU7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Bap1Q99PU7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Bap1Q99PU7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bap1Q99PU7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bap1Q99PU7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bap1Q99PU7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bap1Q99PU7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bap1Q99PU7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bap1Q99PU7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Bap1Q99PU7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Bap1Q99PU7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Bap1Q99PU7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Bap1Q99PU7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Bap1Q99PU7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Bap1Q99PU7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Bap1Q99PU7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Bap1Q99PU7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Bap1Q99PU7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Bap1Q99PU7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Bap1Q99PU7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Bap1Q99PU7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Bap1Q99PU7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Bap1Q99PU7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Bap1Q99PU7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Bap1Q99PU7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Bap1Q99PU7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bap1Q99PU7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bap1Q99PU7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bap1Q99PU7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bap1Q99PU7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bap1Q99PU7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bap1Q99PU7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Bap1Q99PU7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Bap1Q99PU7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Bap1Q99PU7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Bap1Q99PU7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Bap1Q99PU7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Bap1Q99PU7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Bap1Q99PU7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Bap1Q99PU7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Bap1Q99PU7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Bap1Q99PU7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Bap1Q99PU7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Bap1Q99PU7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Bap1Q99PU7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Bap1Q99PU7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Bap1Q99PU7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Bap1Q99PU7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Bap1Q99PU7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Bap1Q99PU7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Bap1Q99PU7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Bap1Q99PU7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Bap1Q99PU7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Bap1Q99PU7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Bap1Q99PU7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Bap1Q99PU7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Bap1Q99PU7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Bap1Q99PU7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bap1Q99PU7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bap1Q99PU7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bap1Q99PU7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bap1Q99PU7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Bap1Q99PU7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Bap1Q99PU7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Bap1Q99PU7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Bap1Q99PU7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Bap1Q99PU7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Bap1Q99PU7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bap1Q99PU7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bap1Q99PU7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms