Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trim26Q99PN3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trim26Q99PN3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trim26Q99PN3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Trim26Q99PN3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trim26Q99PN3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trim26Q99PN3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trim26Q99PN3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trim26Q99PN3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trim26Q99PN3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trim26Q99PN3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trim26Q99PN3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trim26Q99PN3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Trim26Q99PN3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trim26Q99PN3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trim26Q99PN3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trim26Q99PN3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trim26Q99PN3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trim26Q99PN3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trim26Q99PN3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trim26Q99PN3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Trim26Q99PN3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trim26Q99PN3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trim26Q99PN3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trim26Q99PN3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trim26Q99PN3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trim26Q99PN3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trim26Q99PN3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trim26Q99PN3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trim26Q99PN3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trim26Q99PN3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trim26Q99PN3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trim26Q99PN3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trim26Q99PN3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trim26Q99PN3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trim26Q99PN3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trim26Q99PN3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trim26Q99PN3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trim26Q99PN3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trim26Q99PN3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim26Q99PN3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim26Q99PN3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim26Q99PN3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim26Q99PN3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim26Q99PN3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim26Q99PN3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim26Q99PN3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim26Q99PN3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim26Q99PN3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trim26Q99PN3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trim26Q99PN3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trim26Q99PN3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trim26Q99PN3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trim26Q99PN3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trim26Q99PN3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trim26Q99PN3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trim26Q99PN3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trim26Q99PN3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trim26Q99PN3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trim26Q99PN3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trim26Q99PN3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trim26Q99PN3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trim26Q99PN3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trim26Q99PN3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trim26Q99PN3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trim26Q99PN3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trim26Q99PN3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trim26Q99PN3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trim26Q99PN3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trim26Q99PN3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trim26Q99PN3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trim26Q99PN3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Trim26Q99PN3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trim26Q99PN3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Trim26Q99PN3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trim26Q99PN3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trim26Q99PN3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trim26Q99PN3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trim26Q99PN3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trim26Q99PN3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trim26Q99PN3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trim26Q99PN3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trim26Q99PN3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trim26Q99PN3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trim26Q99PN3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trim26Q99PN3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trim26Q99PN3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trim26Q99PN3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trim26Q99PN3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trim26Q99PN3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Trim26Q99PN3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trim26Q99PN3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trim26Q99PN3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trim26Q99PN3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trim26Q99PN3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Trim26Q99PN3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Trim26Q99PN3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Trim26Q99PN3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trim26Q99PN3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trim26Q99PN3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms