Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scd3Q99PL7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scd3Q99PL7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scd3Q99PL7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scd3Q99PL7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Scd3Q99PL7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scd3Q99PL7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scd3Q99PL7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scd3Q99PL7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scd3Q99PL7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scd3Q99PL7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Scd3Q99PL7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scd3Q99PL7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scd3Q99PL7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Scd3Q99PL7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scd3Q99PL7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Scd3Q99PL7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Scd3Q99PL7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Scd3Q99PL7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Scd3Q99PL7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Scd3Q99PL7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Scd3Q99PL7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Scd3Q99PL7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Scd3Q99PL7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Scd3Q99PL7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Scd3Q99PL7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Scd3Q99PL7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Scd3Q99PL7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Scd3Q99PL7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Scd3Q99PL7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Scd3Q99PL7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Scd3Q99PL7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Scd3Q99PL7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Scd3Q99PL7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Scd3Q99PL7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Scd3Q99PL7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Scd3Q99PL7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Scd3Q99PL7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Scd3Q99PL7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Scd3Q99PL7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Scd3Q99PL7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Scd3Q99PL7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Scd3Q99PL7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Scd3Q99PL7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Scd3Q99PL7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Scd3Q99PL7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Scd3Q99PL7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Scd3Q99PL7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Scd3Q99PL7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Scd3Q99PL7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Scd3Q99PL7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Scd3Q99PL7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Scd3Q99PL7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Scd3Q99PL7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scd3Q99PL7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scd3Q99PL7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scd3Q99PL7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Scd3Q99PL7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scd3Q99PL7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scd3Q99PL7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Scd3Q99PL7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Scd3Q99PL7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Scd3Q99PL7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Scd3Q99PL7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scd3Q99PL7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scd3Q99PL7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scd3Q99PL7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scd3Q99PL7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scd3Q99PL7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scd3Q99PL7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scd3Q99PL7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scd3Q99PL7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scd3Q99PL7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scd3Q99PL7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scd3Q99PL7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scd3Q99PL7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scd3Q99PL7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scd3Q99PL7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scd3Q99PL7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scd3Q99PL7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scd3Q99PL7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scd3Q99PL7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Scd3Q99PL7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scd3Q99PL7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scd3Q99PL7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scd3Q99PL7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scd3Q99PL7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Scd3Q99PL7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Scd3Q99PL7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Scd3Q99PL7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Scd3Q99PL7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scd3Q99PL7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scd3Q99PL7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scd3Q99PL7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Scd3Q99PL7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scd3Q99PL7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scd3Q99PL7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scd3Q99PL7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scd3Q99PL7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scd3Q99PL7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms