Protein–RNA interactions for Protein: Q99PA7

4930550L24Rik, MCG117379, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930550L24RikQ99PA7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930550L24RikQ99PA7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930550L24RikQ99PA7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930550L24RikQ99PA7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
4930550L24RikQ99PA7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930550L24RikQ99PA7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930550L24RikQ99PA7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
4930550L24RikQ99PA7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
4930550L24RikQ99PA7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
4930550L24RikQ99PA7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
4930550L24RikQ99PA7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930550L24RikQ99PA7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930550L24RikQ99PA7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930550L24RikQ99PA7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930550L24RikQ99PA7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930550L24RikQ99PA7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
4930550L24RikQ99PA7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930550L24RikQ99PA7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930550L24RikQ99PA7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930550L24RikQ99PA7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930550L24RikQ99PA7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930550L24RikQ99PA7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930550L24RikQ99PA7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930550L24RikQ99PA7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
4930550L24RikQ99PA7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930550L24RikQ99PA7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930550L24RikQ99PA7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930550L24RikQ99PA7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930550L24RikQ99PA7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930550L24RikQ99PA7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930550L24RikQ99PA7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930550L24RikQ99PA7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930550L24RikQ99PA7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930550L24RikQ99PA7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930550L24RikQ99PA7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930550L24RikQ99PA7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930550L24RikQ99PA7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930550L24RikQ99PA7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930550L24RikQ99PA7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930550L24RikQ99PA7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
4930550L24RikQ99PA7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
4930550L24RikQ99PA7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
4930550L24RikQ99PA7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
4930550L24RikQ99PA7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930550L24RikQ99PA7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930550L24RikQ99PA7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930550L24RikQ99PA7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930550L24RikQ99PA7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930550L24RikQ99PA7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930550L24RikQ99PA7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930550L24RikQ99PA7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930550L24RikQ99PA7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930550L24RikQ99PA7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930550L24RikQ99PA7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930550L24RikQ99PA7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930550L24RikQ99PA7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930550L24RikQ99PA7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930550L24RikQ99PA7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930550L24RikQ99PA7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930550L24RikQ99PA7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930550L24RikQ99PA7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930550L24RikQ99PA7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
4930550L24RikQ99PA7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930550L24RikQ99PA7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930550L24RikQ99PA7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930550L24RikQ99PA7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930550L24RikQ99PA7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930550L24RikQ99PA7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930550L24RikQ99PA7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930550L24RikQ99PA7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930550L24RikQ99PA7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930550L24RikQ99PA7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930550L24RikQ99PA7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930550L24RikQ99PA7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930550L24RikQ99PA7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930550L24RikQ99PA7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930550L24RikQ99PA7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930550L24RikQ99PA7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930550L24RikQ99PA7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930550L24RikQ99PA7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930550L24RikQ99PA7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930550L24RikQ99PA7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930550L24RikQ99PA7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930550L24RikQ99PA7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930550L24RikQ99PA7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930550L24RikQ99PA7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
4930550L24RikQ99PA7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930550L24RikQ99PA7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930550L24RikQ99PA7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930550L24RikQ99PA7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930550L24RikQ99PA7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930550L24RikQ99PA7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930550L24RikQ99PA7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
4930550L24RikQ99PA7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930550L24RikQ99PA7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930550L24RikQ99PA7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930550L24RikQ99PA7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930550L24RikQ99PA7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930550L24RikQ99PA7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930550L24RikQ99PA7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms