Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep41Q99NF3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep41Q99NF3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cep41Q99NF3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cep41Q99NF3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cep41Q99NF3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Cep41Q99NF3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cep41Q99NF3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cep41Q99NF3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cep41Q99NF3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cep41Q99NF3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cep41Q99NF3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cep41Q99NF3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cep41Q99NF3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cep41Q99NF3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cep41Q99NF3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cep41Q99NF3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cep41Q99NF3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cep41Q99NF3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cep41Q99NF3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cep41Q99NF3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cep41Q99NF3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cep41Q99NF3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cep41Q99NF3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cep41Q99NF3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cep41Q99NF3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cep41Q99NF3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cep41Q99NF3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cep41Q99NF3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cep41Q99NF3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cep41Q99NF3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cep41Q99NF3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cep41Q99NF3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cep41Q99NF3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Cep41Q99NF3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cep41Q99NF3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cep41Q99NF3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cep41Q99NF3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cep41Q99NF3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cep41Q99NF3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cep41Q99NF3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cep41Q99NF3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cep41Q99NF3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cep41Q99NF3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cep41Q99NF3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cep41Q99NF3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cep41Q99NF3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cep41Q99NF3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cep41Q99NF3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cep41Q99NF3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cep41Q99NF3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cep41Q99NF3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cep41Q99NF3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cep41Q99NF3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cep41Q99NF3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cep41Q99NF3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cep41Q99NF3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cep41Q99NF3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cep41Q99NF3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cep41Q99NF3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cep41Q99NF3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cep41Q99NF3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cep41Q99NF3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cep41Q99NF3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cep41Q99NF3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cep41Q99NF3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cep41Q99NF3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cep41Q99NF3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cep41Q99NF3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cep41Q99NF3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cep41Q99NF3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cep41Q99NF3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cep41Q99NF3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cep41Q99NF3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cep41Q99NF3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cep41Q99NF3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cep41Q99NF3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cep41Q99NF3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cep41Q99NF3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cep41Q99NF3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cep41Q99NF3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cep41Q99NF3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cep41Q99NF3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cep41Q99NF3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cep41Q99NF3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cep41Q99NF3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cep41Q99NF3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cep41Q99NF3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cep41Q99NF3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cep41Q99NF3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cep41Q99NF3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cep41Q99NF3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cep41Q99NF3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cep41Q99NF3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cep41Q99NF3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cep41Q99NF3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cep41Q99NF3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cep41Q99NF3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cep41Q99NF3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cep41Q99NF3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms