Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB3

Tcam1, Cell adhesion molecule TCAM-1, mousemouse

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Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcam1Q99NB3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcam1Q99NB3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcam1Q99NB3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcam1Q99NB3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcam1Q99NB3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcam1Q99NB3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcam1Q99NB3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcam1Q99NB3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcam1Q99NB3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcam1Q99NB3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcam1Q99NB3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcam1Q99NB3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcam1Q99NB3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcam1Q99NB3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcam1Q99NB3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcam1Q99NB3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcam1Q99NB3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcam1Q99NB3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcam1Q99NB3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcam1Q99NB3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcam1Q99NB3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcam1Q99NB3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcam1Q99NB3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcam1Q99NB3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcam1Q99NB3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcam1Q99NB3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcam1Q99NB3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcam1Q99NB3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcam1Q99NB3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcam1Q99NB3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcam1Q99NB3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcam1Q99NB3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcam1Q99NB3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcam1Q99NB3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcam1Q99NB3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcam1Q99NB3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcam1Q99NB3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcam1Q99NB3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcam1Q99NB3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcam1Q99NB3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcam1Q99NB3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcam1Q99NB3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcam1Q99NB3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcam1Q99NB3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcam1Q99NB3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcam1Q99NB3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tcam1Q99NB3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcam1Q99NB3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcam1Q99NB3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcam1Q99NB3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcam1Q99NB3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcam1Q99NB3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcam1Q99NB3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcam1Q99NB3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcam1Q99NB3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcam1Q99NB3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcam1Q99NB3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcam1Q99NB3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcam1Q99NB3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcam1Q99NB3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcam1Q99NB3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcam1Q99NB3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcam1Q99NB3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcam1Q99NB3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcam1Q99NB3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcam1Q99NB3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcam1Q99NB3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcam1Q99NB3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcam1Q99NB3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcam1Q99NB3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcam1Q99NB3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcam1Q99NB3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcam1Q99NB3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcam1Q99NB3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcam1Q99NB3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcam1Q99NB3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcam1Q99NB3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcam1Q99NB3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcam1Q99NB3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcam1Q99NB3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcam1Q99NB3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcam1Q99NB3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcam1Q99NB3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcam1Q99NB3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcam1Q99NB3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcam1Q99NB3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcam1Q99NB3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcam1Q99NB3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcam1Q99NB3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcam1Q99NB3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcam1Q99NB3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcam1Q99NB3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcam1Q99NB3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcam1Q99NB3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcam1Q99NB3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcam1Q99NB3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tcam1Q99NB3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tcam1Q99NB3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tcam1Q99NB3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tcam1Q99NB3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154 ms