Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR8

Mccc1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc1Q99MR8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mccc1Q99MR8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mccc1Q99MR8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mccc1Q99MR8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mccc1Q99MR8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mccc1Q99MR8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mccc1Q99MR8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mccc1Q99MR8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mccc1Q99MR8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mccc1Q99MR8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mccc1Q99MR8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mccc1Q99MR8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mccc1Q99MR8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mccc1Q99MR8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mccc1Q99MR8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mccc1Q99MR8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mccc1Q99MR8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mccc1Q99MR8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mccc1Q99MR8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mccc1Q99MR8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mccc1Q99MR8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Mccc1Q99MR8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mccc1Q99MR8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Mccc1Q99MR8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Mccc1Q99MR8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mccc1Q99MR8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mccc1Q99MR8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mccc1Q99MR8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mccc1Q99MR8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mccc1Q99MR8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mccc1Q99MR8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mccc1Q99MR8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mccc1Q99MR8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Mccc1Q99MR8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mccc1Q99MR8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mccc1Q99MR8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mccc1Q99MR8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mccc1Q99MR8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mccc1Q99MR8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mccc1Q99MR8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mccc1Q99MR8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mccc1Q99MR8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mccc1Q99MR8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mccc1Q99MR8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mccc1Q99MR8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mccc1Q99MR8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mccc1Q99MR8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mccc1Q99MR8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mccc1Q99MR8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mccc1Q99MR8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mccc1Q99MR8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mccc1Q99MR8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mccc1Q99MR8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mccc1Q99MR8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mccc1Q99MR8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Mccc1Q99MR8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mccc1Q99MR8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mccc1Q99MR8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mccc1Q99MR8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mccc1Q99MR8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mccc1Q99MR8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mccc1Q99MR8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mccc1Q99MR8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mccc1Q99MR8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mccc1Q99MR8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mccc1Q99MR8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mccc1Q99MR8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Mccc1Q99MR8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mccc1Q99MR8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mccc1Q99MR8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mccc1Q99MR8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mccc1Q99MR8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mccc1Q99MR8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mccc1Q99MR8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mccc1Q99MR8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mccc1Q99MR8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Mccc1Q99MR8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mccc1Q99MR8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mccc1Q99MR8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mccc1Q99MR8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mccc1Q99MR8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mccc1Q99MR8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mccc1Q99MR8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mccc1Q99MR8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Mccc1Q99MR8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mccc1Q99MR8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mccc1Q99MR8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mccc1Q99MR8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mccc1Q99MR8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mccc1Q99MR8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mccc1Q99MR8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mccc1Q99MR8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mccc1Q99MR8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mccc1Q99MR8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mccc1Q99MR8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mccc1Q99MR8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mccc1Q99MR8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mccc1Q99MR8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mccc1Q99MR8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mccc1Q99MR8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms