Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN1

Kars, Lysine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KarsQ99MN1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KarsQ99MN1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KarsQ99MN1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KarsQ99MN1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KarsQ99MN1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KarsQ99MN1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KarsQ99MN1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KarsQ99MN1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KarsQ99MN1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KarsQ99MN1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KarsQ99MN1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KarsQ99MN1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KarsQ99MN1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KarsQ99MN1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KarsQ99MN1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KarsQ99MN1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KarsQ99MN1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KarsQ99MN1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KarsQ99MN1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KarsQ99MN1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KarsQ99MN1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KarsQ99MN1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KarsQ99MN1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KarsQ99MN1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KarsQ99MN1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KarsQ99MN1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KarsQ99MN1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KarsQ99MN1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KarsQ99MN1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KarsQ99MN1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KarsQ99MN1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KarsQ99MN1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KarsQ99MN1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KarsQ99MN1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KarsQ99MN1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KarsQ99MN1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KarsQ99MN1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KarsQ99MN1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KarsQ99MN1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KarsQ99MN1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KarsQ99MN1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KarsQ99MN1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KarsQ99MN1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KarsQ99MN1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KarsQ99MN1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KarsQ99MN1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KarsQ99MN1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KarsQ99MN1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KarsQ99MN1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KarsQ99MN1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KarsQ99MN1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KarsQ99MN1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KarsQ99MN1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KarsQ99MN1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KarsQ99MN1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KarsQ99MN1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KarsQ99MN1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KarsQ99MN1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KarsQ99MN1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KarsQ99MN1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KarsQ99MN1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KarsQ99MN1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KarsQ99MN1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KarsQ99MN1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KarsQ99MN1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KarsQ99MN1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KarsQ99MN1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KarsQ99MN1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KarsQ99MN1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KarsQ99MN1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KarsQ99MN1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KarsQ99MN1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KarsQ99MN1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KarsQ99MN1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KarsQ99MN1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
KarsQ99MN1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KarsQ99MN1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KarsQ99MN1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KarsQ99MN1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KarsQ99MN1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KarsQ99MN1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KarsQ99MN1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KarsQ99MN1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KarsQ99MN1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KarsQ99MN1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KarsQ99MN1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KarsQ99MN1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KarsQ99MN1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KarsQ99MN1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KarsQ99MN1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
KarsQ99MN1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KarsQ99MN1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KarsQ99MN1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KarsQ99MN1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KarsQ99MN1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KarsQ99MN1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KarsQ99MN1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KarsQ99MN1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KarsQ99MN1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KarsQ99MN1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms