Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB1

Tlr3, Toll-like receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr3Q99MB1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tlr3Q99MB1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tlr3Q99MB1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tlr3Q99MB1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tlr3Q99MB1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tlr3Q99MB1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tlr3Q99MB1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlr3Q99MB1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlr3Q99MB1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlr3Q99MB1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tlr3Q99MB1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tlr3Q99MB1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tlr3Q99MB1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tlr3Q99MB1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tlr3Q99MB1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tlr3Q99MB1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tlr3Q99MB1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tlr3Q99MB1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tlr3Q99MB1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tlr3Q99MB1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tlr3Q99MB1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tlr3Q99MB1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tlr3Q99MB1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tlr3Q99MB1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tlr3Q99MB1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tlr3Q99MB1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tlr3Q99MB1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tlr3Q99MB1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tlr3Q99MB1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tlr3Q99MB1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tlr3Q99MB1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tlr3Q99MB1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tlr3Q99MB1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tlr3Q99MB1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tlr3Q99MB1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tlr3Q99MB1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tlr3Q99MB1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tlr3Q99MB1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tlr3Q99MB1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tlr3Q99MB1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tlr3Q99MB1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tlr3Q99MB1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tlr3Q99MB1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tlr3Q99MB1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tlr3Q99MB1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tlr3Q99MB1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tlr3Q99MB1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tlr3Q99MB1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tlr3Q99MB1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tlr3Q99MB1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tlr3Q99MB1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tlr3Q99MB1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Tlr3Q99MB1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tlr3Q99MB1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tlr3Q99MB1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tlr3Q99MB1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tlr3Q99MB1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tlr3Q99MB1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tlr3Q99MB1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tlr3Q99MB1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tlr3Q99MB1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tlr3Q99MB1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tlr3Q99MB1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tlr3Q99MB1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tlr3Q99MB1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tlr3Q99MB1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tlr3Q99MB1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tlr3Q99MB1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tlr3Q99MB1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tlr3Q99MB1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tlr3Q99MB1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tlr3Q99MB1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tlr3Q99MB1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tlr3Q99MB1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tlr3Q99MB1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tlr3Q99MB1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tlr3Q99MB1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tlr3Q99MB1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tlr3Q99MB1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tlr3Q99MB1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tlr3Q99MB1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tlr3Q99MB1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tlr3Q99MB1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tlr3Q99MB1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tlr3Q99MB1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tlr3Q99MB1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tlr3Q99MB1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tlr3Q99MB1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tlr3Q99MB1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlr3Q99MB1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlr3Q99MB1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlr3Q99MB1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlr3Q99MB1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlr3Q99MB1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlr3Q99MB1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlr3Q99MB1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlr3Q99MB1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlr3Q99MB1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlr3Q99MB1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr3Q99MB1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms