Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nmd3Q99L48 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nmd3Q99L48 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nmd3Q99L48 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nmd3Q99L48 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nmd3Q99L48 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nmd3Q99L48 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nmd3Q99L48 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nmd3Q99L48 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nmd3Q99L48 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nmd3Q99L48 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nmd3Q99L48 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nmd3Q99L48 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nmd3Q99L48 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nmd3Q99L48 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nmd3Q99L48 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nmd3Q99L48 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nmd3Q99L48 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nmd3Q99L48 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nmd3Q99L48 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nmd3Q99L48 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nmd3Q99L48 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nmd3Q99L48 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nmd3Q99L48 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nmd3Q99L48 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nmd3Q99L48 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nmd3Q99L48 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nmd3Q99L48 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nmd3Q99L48 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nmd3Q99L48 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nmd3Q99L48 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nmd3Q99L48 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nmd3Q99L48 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nmd3Q99L48 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nmd3Q99L48 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nmd3Q99L48 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nmd3Q99L48 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nmd3Q99L48 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nmd3Q99L48 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nmd3Q99L48 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nmd3Q99L48 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nmd3Q99L48 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nmd3Q99L48 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nmd3Q99L48 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Nmd3Q99L48 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nmd3Q99L48 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nmd3Q99L48 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nmd3Q99L48 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nmd3Q99L48 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nmd3Q99L48 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nmd3Q99L48 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nmd3Q99L48 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nmd3Q99L48 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nmd3Q99L48 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nmd3Q99L48 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nmd3Q99L48 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nmd3Q99L48 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nmd3Q99L48 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nmd3Q99L48 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Nmd3Q99L48 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nmd3Q99L48 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nmd3Q99L48 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nmd3Q99L48 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nmd3Q99L48 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nmd3Q99L48 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Nmd3Q99L48 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nmd3Q99L48 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nmd3Q99L48 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nmd3Q99L48 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nmd3Q99L48 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nmd3Q99L48 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nmd3Q99L48 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nmd3Q99L48 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nmd3Q99L48 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nmd3Q99L48 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nmd3Q99L48 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nmd3Q99L48 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nmd3Q99L48 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nmd3Q99L48 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nmd3Q99L48 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nmd3Q99L48 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nmd3Q99L48 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nmd3Q99L48 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nmd3Q99L48 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nmd3Q99L48 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nmd3Q99L48 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nmd3Q99L48 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nmd3Q99L48 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nmd3Q99L48 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nmd3Q99L48 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nmd3Q99L48 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nmd3Q99L48 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nmd3Q99L48 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nmd3Q99L48 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nmd3Q99L48 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nmd3Q99L48 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nmd3Q99L48 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nmd3Q99L48 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nmd3Q99L48 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nmd3Q99L48 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms