Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmed9Q99KF1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmed9Q99KF1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmed9Q99KF1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmed9Q99KF1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmed9Q99KF1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmed9Q99KF1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmed9Q99KF1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmed9Q99KF1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmed9Q99KF1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmed9Q99KF1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmed9Q99KF1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmed9Q99KF1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmed9Q99KF1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmed9Q99KF1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmed9Q99KF1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmed9Q99KF1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmed9Q99KF1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmed9Q99KF1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmed9Q99KF1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmed9Q99KF1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmed9Q99KF1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmed9Q99KF1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmed9Q99KF1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmed9Q99KF1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmed9Q99KF1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmed9Q99KF1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmed9Q99KF1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmed9Q99KF1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmed9Q99KF1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmed9Q99KF1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmed9Q99KF1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmed9Q99KF1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmed9Q99KF1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmed9Q99KF1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmed9Q99KF1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmed9Q99KF1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmed9Q99KF1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmed9Q99KF1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmed9Q99KF1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmed9Q99KF1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmed9Q99KF1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmed9Q99KF1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmed9Q99KF1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmed9Q99KF1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmed9Q99KF1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmed9Q99KF1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmed9Q99KF1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmed9Q99KF1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmed9Q99KF1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmed9Q99KF1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmed9Q99KF1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmed9Q99KF1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmed9Q99KF1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmed9Q99KF1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmed9Q99KF1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmed9Q99KF1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmed9Q99KF1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmed9Q99KF1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmed9Q99KF1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmed9Q99KF1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmed9Q99KF1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmed9Q99KF1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmed9Q99KF1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmed9Q99KF1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmed9Q99KF1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmed9Q99KF1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmed9Q99KF1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmed9Q99KF1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmed9Q99KF1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmed9Q99KF1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmed9Q99KF1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmed9Q99KF1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmed9Q99KF1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmed9Q99KF1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmed9Q99KF1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmed9Q99KF1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmed9Q99KF1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmed9Q99KF1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmed9Q99KF1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmed9Q99KF1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmed9Q99KF1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmed9Q99KF1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmed9Q99KF1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tmed9Q99KF1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tmed9Q99KF1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tmed9Q99KF1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmed9Q99KF1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmed9Q99KF1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmed9Q99KF1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmed9Q99KF1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmed9Q99KF1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmed9Q99KF1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmed9Q99KF1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmed9Q99KF1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmed9Q99KF1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmed9Q99KF1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmed9Q99KF1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmed9Q99KF1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmed9Q99KF1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms