Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp11Q99K46 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp11Q99K46 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp11Q99K46 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp11Q99K46 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp11Q99K46 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp11Q99K46 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp11Q99K46 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp11Q99K46 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp11Q99K46 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp11Q99K46 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp11Q99K46 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp11Q99K46 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp11Q99K46 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp11Q99K46 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp11Q99K46 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp11Q99K46 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp11Q99K46 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp11Q99K46 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp11Q99K46 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp11Q99K46 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp11Q99K46 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp11Q99K46 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp11Q99K46 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Usp11Q99K46 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp11Q99K46 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp11Q99K46 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp11Q99K46 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp11Q99K46 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp11Q99K46 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp11Q99K46 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp11Q99K46 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp11Q99K46 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp11Q99K46 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp11Q99K46 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp11Q99K46 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp11Q99K46 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp11Q99K46 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp11Q99K46 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp11Q99K46 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp11Q99K46 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp11Q99K46 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp11Q99K46 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp11Q99K46 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp11Q99K46 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp11Q99K46 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms