Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Def8Q99J78 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Def8Q99J78 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Def8Q99J78 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Def8Q99J78 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Def8Q99J78 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Def8Q99J78 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Def8Q99J78 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Def8Q99J78 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Def8Q99J78 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Def8Q99J78 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Def8Q99J78 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Def8Q99J78 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Def8Q99J78 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Def8Q99J78 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Def8Q99J78 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Def8Q99J78 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Def8Q99J78 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Def8Q99J78 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Def8Q99J78 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Def8Q99J78 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Def8Q99J78 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Def8Q99J78 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Def8Q99J78 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Def8Q99J78 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Def8Q99J78 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Def8Q99J78 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Def8Q99J78 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Def8Q99J78 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Def8Q99J78 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Def8Q99J78 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Def8Q99J78 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Def8Q99J78 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Def8Q99J78 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Def8Q99J78 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Def8Q99J78 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Def8Q99J78 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Def8Q99J78 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Def8Q99J78 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Def8Q99J78 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Def8Q99J78 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Def8Q99J78 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Def8Q99J78 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Def8Q99J78 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Def8Q99J78 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Def8Q99J78 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Def8Q99J78 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Def8Q99J78 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Def8Q99J78 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Def8Q99J78 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Def8Q99J78 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Def8Q99J78 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Def8Q99J78 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Def8Q99J78 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Def8Q99J78 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Def8Q99J78 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Def8Q99J78 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Def8Q99J78 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Def8Q99J78 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Def8Q99J78 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Def8Q99J78 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Def8Q99J78 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Def8Q99J78 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Def8Q99J78 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Def8Q99J78 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Def8Q99J78 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Def8Q99J78 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Def8Q99J78 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Def8Q99J78 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Def8Q99J78 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Def8Q99J78 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Def8Q99J78 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Def8Q99J78 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Def8Q99J78 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Def8Q99J78 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Def8Q99J78 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Def8Q99J78 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Def8Q99J78 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Def8Q99J78 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Def8Q99J78 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Def8Q99J78 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Def8Q99J78 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Def8Q99J78 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Def8Q99J78 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Def8Q99J78 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Def8Q99J78 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Def8Q99J78 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Def8Q99J78 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Def8Q99J78 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Def8Q99J78 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Def8Q99J78 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Def8Q99J78 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Def8Q99J78 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Def8Q99J78 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Def8Q99J78 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Def8Q99J78 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Def8Q99J78 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Def8Q99J78 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Def8Q99J78 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Def8Q99J78 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms