Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn16Q925N4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn16Q925N4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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Cldn16Q925N4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn16Q925N4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn16Q925N4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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Cldn16Q925N4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn16Q925N4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn16Q925N4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn16Q925N4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn16Q925N4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn16Q925N4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn16Q925N4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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Cldn16Q925N4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn16Q925N4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn16Q925N4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn16Q925N4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn16Q925N4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn16Q925N4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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Cldn16Q925N4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn16Q925N4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Cldn16Q925N4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Cldn16Q925N4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn16Q925N4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Cldn16Q925N4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Cldn16Q925N4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn16Q925N4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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Cldn16Q925N4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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Cldn16Q925N4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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Cldn16Q925N4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn16Q925N4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Cldn16Q925N4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Cldn16Q925N4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn16Q925N4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Cldn16Q925N4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cldn16Q925N4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cldn16Q925N4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn16Q925N4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn16Q925N4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn16Q925N4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn16Q925N4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn16Q925N4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn16Q925N4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn16Q925N4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn16Q925N4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn16Q925N4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn16Q925N4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn16Q925N4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn16Q925N4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn16Q925N4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn16Q925N4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn16Q925N4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn16Q925N4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn16Q925N4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn16Q925N4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn16Q925N4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn16Q925N4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn16Q925N4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn16Q925N4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn16Q925N4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn16Q925N4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn16Q925N4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn16Q925N4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn16Q925N4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn16Q925N4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms