Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trim59Q922Y2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trim59Q922Y2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim59Q922Y2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim59Q922Y2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim59Q922Y2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim59Q922Y2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim59Q922Y2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim59Q922Y2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim59Q922Y2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim59Q922Y2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim59Q922Y2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim59Q922Y2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim59Q922Y2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim59Q922Y2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim59Q922Y2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim59Q922Y2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim59Q922Y2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim59Q922Y2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim59Q922Y2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim59Q922Y2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim59Q922Y2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim59Q922Y2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim59Q922Y2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim59Q922Y2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim59Q922Y2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim59Q922Y2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim59Q922Y2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim59Q922Y2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim59Q922Y2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim59Q922Y2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim59Q922Y2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim59Q922Y2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim59Q922Y2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim59Q922Y2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim59Q922Y2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim59Q922Y2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim59Q922Y2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim59Q922Y2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim59Q922Y2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim59Q922Y2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim59Q922Y2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim59Q922Y2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim59Q922Y2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim59Q922Y2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Trim59Q922Y2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Trim59Q922Y2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim59Q922Y2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim59Q922Y2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim59Q922Y2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim59Q922Y2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim59Q922Y2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim59Q922Y2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim59Q922Y2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim59Q922Y2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim59Q922Y2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim59Q922Y2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim59Q922Y2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim59Q922Y2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim59Q922Y2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim59Q922Y2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim59Q922Y2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim59Q922Y2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim59Q922Y2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim59Q922Y2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim59Q922Y2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim59Q922Y2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim59Q922Y2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim59Q922Y2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim59Q922Y2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim59Q922Y2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim59Q922Y2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim59Q922Y2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim59Q922Y2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim59Q922Y2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim59Q922Y2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim59Q922Y2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim59Q922Y2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim59Q922Y2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim59Q922Y2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim59Q922Y2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim59Q922Y2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim59Q922Y2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim59Q922Y2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim59Q922Y2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim59Q922Y2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim59Q922Y2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim59Q922Y2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trim59Q922Y2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim59Q922Y2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trim59Q922Y2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim59Q922Y2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Trim59Q922Y2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim59Q922Y2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim59Q922Y2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim59Q922Y2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim59Q922Y2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim59Q922Y2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim59Q922Y2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim59Q922Y2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms