Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Odf3Q920N1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Odf3Q920N1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Odf3Q920N1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf3Q920N1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf3Q920N1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf3Q920N1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf3Q920N1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf3Q920N1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf3Q920N1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf3Q920N1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf3Q920N1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf3Q920N1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf3Q920N1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf3Q920N1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf3Q920N1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf3Q920N1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf3Q920N1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf3Q920N1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf3Q920N1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf3Q920N1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf3Q920N1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf3Q920N1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf3Q920N1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf3Q920N1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf3Q920N1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Odf3Q920N1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Odf3Q920N1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Odf3Q920N1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Odf3Q920N1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Odf3Q920N1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf3Q920N1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf3Q920N1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf3Q920N1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf3Q920N1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf3Q920N1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf3Q920N1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf3Q920N1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf3Q920N1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf3Q920N1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf3Q920N1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf3Q920N1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf3Q920N1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf3Q920N1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf3Q920N1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf3Q920N1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf3Q920N1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms