Protein–RNA interactions for Protein: Q920E5

Fdps, Farnesyl pyrophosphate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FdpsQ920E5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FdpsQ920E5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FdpsQ920E5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FdpsQ920E5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FdpsQ920E5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FdpsQ920E5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FdpsQ920E5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FdpsQ920E5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FdpsQ920E5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FdpsQ920E5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FdpsQ920E5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FdpsQ920E5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FdpsQ920E5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FdpsQ920E5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FdpsQ920E5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FdpsQ920E5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FdpsQ920E5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FdpsQ920E5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FdpsQ920E5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FdpsQ920E5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FdpsQ920E5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FdpsQ920E5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FdpsQ920E5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FdpsQ920E5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FdpsQ920E5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FdpsQ920E5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FdpsQ920E5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FdpsQ920E5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FdpsQ920E5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FdpsQ920E5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FdpsQ920E5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FdpsQ920E5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FdpsQ920E5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FdpsQ920E5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FdpsQ920E5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FdpsQ920E5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FdpsQ920E5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FdpsQ920E5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FdpsQ920E5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FdpsQ920E5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FdpsQ920E5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FdpsQ920E5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FdpsQ920E5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FdpsQ920E5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FdpsQ920E5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FdpsQ920E5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FdpsQ920E5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FdpsQ920E5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FdpsQ920E5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FdpsQ920E5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FdpsQ920E5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FdpsQ920E5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FdpsQ920E5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FdpsQ920E5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FdpsQ920E5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FdpsQ920E5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FdpsQ920E5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FdpsQ920E5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FdpsQ920E5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FdpsQ920E5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FdpsQ920E5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FdpsQ920E5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FdpsQ920E5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FdpsQ920E5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FdpsQ920E5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FdpsQ920E5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FdpsQ920E5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FdpsQ920E5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FdpsQ920E5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FdpsQ920E5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FdpsQ920E5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FdpsQ920E5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FdpsQ920E5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FdpsQ920E5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FdpsQ920E5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FdpsQ920E5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FdpsQ920E5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FdpsQ920E5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FdpsQ920E5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FdpsQ920E5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FdpsQ920E5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FdpsQ920E5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
FdpsQ920E5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FdpsQ920E5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FdpsQ920E5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FdpsQ920E5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FdpsQ920E5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FdpsQ920E5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FdpsQ920E5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FdpsQ920E5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FdpsQ920E5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FdpsQ920E5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FdpsQ920E5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FdpsQ920E5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FdpsQ920E5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FdpsQ920E5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FdpsQ920E5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FdpsQ920E5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FdpsQ920E5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FdpsQ920E5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms