Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZM2

Sh2b1, SH2B adapter protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2b1Q91ZM2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh2b1Q91ZM2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh2b1Q91ZM2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh2b1Q91ZM2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh2b1Q91ZM2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh2b1Q91ZM2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh2b1Q91ZM2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh2b1Q91ZM2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh2b1Q91ZM2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh2b1Q91ZM2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh2b1Q91ZM2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh2b1Q91ZM2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh2b1Q91ZM2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh2b1Q91ZM2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh2b1Q91ZM2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh2b1Q91ZM2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh2b1Q91ZM2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh2b1Q91ZM2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh2b1Q91ZM2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh2b1Q91ZM2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh2b1Q91ZM2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh2b1Q91ZM2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh2b1Q91ZM2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh2b1Q91ZM2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh2b1Q91ZM2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh2b1Q91ZM2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh2b1Q91ZM2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh2b1Q91ZM2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh2b1Q91ZM2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh2b1Q91ZM2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh2b1Q91ZM2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh2b1Q91ZM2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh2b1Q91ZM2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh2b1Q91ZM2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh2b1Q91ZM2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh2b1Q91ZM2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh2b1Q91ZM2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh2b1Q91ZM2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh2b1Q91ZM2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh2b1Q91ZM2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh2b1Q91ZM2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh2b1Q91ZM2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh2b1Q91ZM2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh2b1Q91ZM2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh2b1Q91ZM2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh2b1Q91ZM2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh2b1Q91ZM2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh2b1Q91ZM2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh2b1Q91ZM2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh2b1Q91ZM2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh2b1Q91ZM2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh2b1Q91ZM2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh2b1Q91ZM2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh2b1Q91ZM2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh2b1Q91ZM2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh2b1Q91ZM2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh2b1Q91ZM2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh2b1Q91ZM2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh2b1Q91ZM2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh2b1Q91ZM2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh2b1Q91ZM2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh2b1Q91ZM2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh2b1Q91ZM2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh2b1Q91ZM2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh2b1Q91ZM2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh2b1Q91ZM2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh2b1Q91ZM2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sh2b1Q91ZM2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh2b1Q91ZM2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh2b1Q91ZM2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh2b1Q91ZM2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh2b1Q91ZM2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh2b1Q91ZM2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh2b1Q91ZM2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh2b1Q91ZM2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh2b1Q91ZM2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh2b1Q91ZM2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh2b1Q91ZM2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh2b1Q91ZM2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh2b1Q91ZM2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh2b1Q91ZM2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh2b1Q91ZM2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh2b1Q91ZM2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh2b1Q91ZM2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh2b1Q91ZM2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh2b1Q91ZM2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh2b1Q91ZM2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh2b1Q91ZM2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh2b1Q91ZM2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh2b1Q91ZM2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh2b1Q91ZM2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh2b1Q91ZM2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh2b1Q91ZM2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh2b1Q91ZM2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sh2b1Q91ZM2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sh2b1Q91ZM2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sh2b1Q91ZM2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sh2b1Q91ZM2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sh2b1Q91ZM2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sh2b1Q91ZM2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms