Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK0

Lrrc49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc49Q91YK0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc49Q91YK0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc49Q91YK0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc49Q91YK0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc49Q91YK0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc49Q91YK0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc49Q91YK0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc49Q91YK0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc49Q91YK0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc49Q91YK0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc49Q91YK0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc49Q91YK0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc49Q91YK0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc49Q91YK0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc49Q91YK0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc49Q91YK0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc49Q91YK0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrc49Q91YK0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrc49Q91YK0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrc49Q91YK0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrc49Q91YK0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrc49Q91YK0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrc49Q91YK0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrc49Q91YK0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrc49Q91YK0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrc49Q91YK0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrc49Q91YK0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrc49Q91YK0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrc49Q91YK0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrc49Q91YK0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrc49Q91YK0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrc49Q91YK0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrc49Q91YK0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrc49Q91YK0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrc49Q91YK0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrc49Q91YK0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrc49Q91YK0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrc49Q91YK0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc49Q91YK0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc49Q91YK0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc49Q91YK0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc49Q91YK0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc49Q91YK0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc49Q91YK0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc49Q91YK0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc49Q91YK0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc49Q91YK0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc49Q91YK0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc49Q91YK0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc49Q91YK0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc49Q91YK0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc49Q91YK0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc49Q91YK0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc49Q91YK0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc49Q91YK0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc49Q91YK0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc49Q91YK0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc49Q91YK0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc49Q91YK0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc49Q91YK0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc49Q91YK0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lrrc49Q91YK0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lrrc49Q91YK0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lrrc49Q91YK0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc49Q91YK0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc49Q91YK0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc49Q91YK0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc49Q91YK0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc49Q91YK0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc49Q91YK0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc49Q91YK0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc49Q91YK0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc49Q91YK0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc49Q91YK0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc49Q91YK0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc49Q91YK0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc49Q91YK0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc49Q91YK0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc49Q91YK0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc49Q91YK0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc49Q91YK0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc49Q91YK0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc49Q91YK0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc49Q91YK0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc49Q91YK0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc49Q91YK0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc49Q91YK0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc49Q91YK0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc49Q91YK0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc49Q91YK0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc49Q91YK0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc49Q91YK0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc49Q91YK0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc49Q91YK0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc49Q91YK0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc49Q91YK0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc49Q91YK0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc49Q91YK0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc49Q91YK0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc49Q91YK0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms