Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx4Q91YJ2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx4Q91YJ2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx4Q91YJ2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx4Q91YJ2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx4Q91YJ2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx4Q91YJ2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx4Q91YJ2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx4Q91YJ2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx4Q91YJ2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx4Q91YJ2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx4Q91YJ2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx4Q91YJ2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx4Q91YJ2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx4Q91YJ2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx4Q91YJ2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx4Q91YJ2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx4Q91YJ2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx4Q91YJ2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx4Q91YJ2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx4Q91YJ2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx4Q91YJ2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx4Q91YJ2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx4Q91YJ2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx4Q91YJ2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snx4Q91YJ2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snx4Q91YJ2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snx4Q91YJ2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snx4Q91YJ2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snx4Q91YJ2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snx4Q91YJ2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snx4Q91YJ2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snx4Q91YJ2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx4Q91YJ2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx4Q91YJ2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx4Q91YJ2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx4Q91YJ2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx4Q91YJ2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx4Q91YJ2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx4Q91YJ2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx4Q91YJ2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx4Q91YJ2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx4Q91YJ2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx4Q91YJ2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx4Q91YJ2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx4Q91YJ2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx4Q91YJ2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx4Q91YJ2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx4Q91YJ2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx4Q91YJ2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx4Q91YJ2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx4Q91YJ2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx4Q91YJ2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx4Q91YJ2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx4Q91YJ2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx4Q91YJ2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx4Q91YJ2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms