Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y15

Pcdha5, Protocadherin alpha 5, mousemouse

Predictions only

Length 934 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha5Q91Y15 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdha5Q91Y15 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdha5Q91Y15 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdha5Q91Y15 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdha5Q91Y15 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdha5Q91Y15 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdha5Q91Y15 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdha5Q91Y15 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdha5Q91Y15 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdha5Q91Y15 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdha5Q91Y15 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdha5Q91Y15 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcdha5Q91Y15 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdha5Q91Y15 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdha5Q91Y15 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdha5Q91Y15 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdha5Q91Y15 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdha5Q91Y15 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdha5Q91Y15 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdha5Q91Y15 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdha5Q91Y15 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdha5Q91Y15 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdha5Q91Y15 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdha5Q91Y15 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdha5Q91Y15 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdha5Q91Y15 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdha5Q91Y15 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdha5Q91Y15 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdha5Q91Y15 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdha5Q91Y15 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdha5Q91Y15 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdha5Q91Y15 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdha5Q91Y15 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdha5Q91Y15 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdha5Q91Y15 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdha5Q91Y15 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdha5Q91Y15 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdha5Q91Y15 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdha5Q91Y15 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdha5Q91Y15 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdha5Q91Y15 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdha5Q91Y15 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdha5Q91Y15 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdha5Q91Y15 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pcdha5Q91Y15 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Pcdha5Q91Y15 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdha5Q91Y15 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdha5Q91Y15 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdha5Q91Y15 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdha5Q91Y15 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdha5Q91Y15 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdha5Q91Y15 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdha5Q91Y15 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdha5Q91Y15 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdha5Q91Y15 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdha5Q91Y15 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdha5Q91Y15 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdha5Q91Y15 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdha5Q91Y15 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdha5Q91Y15 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdha5Q91Y15 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdha5Q91Y15 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdha5Q91Y15 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdha5Q91Y15 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdha5Q91Y15 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdha5Q91Y15 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdha5Q91Y15 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdha5Q91Y15 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdha5Q91Y15 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdha5Q91Y15 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdha5Q91Y15 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdha5Q91Y15 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdha5Q91Y15 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdha5Q91Y15 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdha5Q91Y15 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdha5Q91Y15 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdha5Q91Y15 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdha5Q91Y15 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdha5Q91Y15 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdha5Q91Y15 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdha5Q91Y15 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdha5Q91Y15 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdha5Q91Y15 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdha5Q91Y15 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdha5Q91Y15 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdha5Q91Y15 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdha5Q91Y15 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdha5Q91Y15 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdha5Q91Y15 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdha5Q91Y15 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdha5Q91Y15 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdha5Q91Y15 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdha5Q91Y15 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdha5Q91Y15 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha5Q91Y15 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha5Q91Y15 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha5Q91Y15 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha5Q91Y15 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha5Q91Y15 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha5Q91Y15 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms