Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD6

Vps36, Vacuolar protein-sorting-associated protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps36Q91XD6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps36Q91XD6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps36Q91XD6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps36Q91XD6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps36Q91XD6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps36Q91XD6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps36Q91XD6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps36Q91XD6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps36Q91XD6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps36Q91XD6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps36Q91XD6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps36Q91XD6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps36Q91XD6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps36Q91XD6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps36Q91XD6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps36Q91XD6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps36Q91XD6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps36Q91XD6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps36Q91XD6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps36Q91XD6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vps36Q91XD6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vps36Q91XD6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vps36Q91XD6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vps36Q91XD6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps36Q91XD6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps36Q91XD6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps36Q91XD6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps36Q91XD6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps36Q91XD6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps36Q91XD6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps36Q91XD6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps36Q91XD6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps36Q91XD6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps36Q91XD6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps36Q91XD6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps36Q91XD6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps36Q91XD6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps36Q91XD6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps36Q91XD6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps36Q91XD6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps36Q91XD6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps36Q91XD6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps36Q91XD6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps36Q91XD6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps36Q91XD6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps36Q91XD6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps36Q91XD6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps36Q91XD6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps36Q91XD6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps36Q91XD6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps36Q91XD6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps36Q91XD6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps36Q91XD6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps36Q91XD6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps36Q91XD6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps36Q91XD6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps36Q91XD6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps36Q91XD6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps36Q91XD6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps36Q91XD6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps36Q91XD6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps36Q91XD6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps36Q91XD6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps36Q91XD6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps36Q91XD6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vps36Q91XD6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vps36Q91XD6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vps36Q91XD6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps36Q91XD6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps36Q91XD6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps36Q91XD6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps36Q91XD6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps36Q91XD6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps36Q91XD6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps36Q91XD6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps36Q91XD6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps36Q91XD6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps36Q91XD6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps36Q91XD6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps36Q91XD6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps36Q91XD6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps36Q91XD6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps36Q91XD6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps36Q91XD6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps36Q91XD6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps36Q91XD6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps36Q91XD6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps36Q91XD6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps36Q91XD6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps36Q91XD6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps36Q91XD6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps36Q91XD6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps36Q91XD6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps36Q91XD6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps36Q91XD6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps36Q91XD6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps36Q91XD6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps36Q91XD6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps36Q91XD6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vps36Q91XD6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms