Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Setd3Q91WC0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Setd3Q91WC0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Setd3Q91WC0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Setd3Q91WC0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Setd3Q91WC0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Setd3Q91WC0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Setd3Q91WC0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Setd3Q91WC0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Setd3Q91WC0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Setd3Q91WC0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Setd3Q91WC0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Setd3Q91WC0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Setd3Q91WC0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Setd3Q91WC0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Setd3Q91WC0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Setd3Q91WC0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Setd3Q91WC0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Setd3Q91WC0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Setd3Q91WC0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Setd3Q91WC0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Setd3Q91WC0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Setd3Q91WC0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Setd3Q91WC0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Setd3Q91WC0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Setd3Q91WC0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Setd3Q91WC0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Setd3Q91WC0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Setd3Q91WC0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Setd3Q91WC0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Setd3Q91WC0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Setd3Q91WC0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Setd3Q91WC0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Setd3Q91WC0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Setd3Q91WC0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Setd3Q91WC0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Setd3Q91WC0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Setd3Q91WC0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Setd3Q91WC0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Setd3Q91WC0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Setd3Q91WC0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Setd3Q91WC0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Setd3Q91WC0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Setd3Q91WC0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Setd3Q91WC0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Setd3Q91WC0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Setd3Q91WC0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Setd3Q91WC0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Setd3Q91WC0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Setd3Q91WC0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Setd3Q91WC0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Setd3Q91WC0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Setd3Q91WC0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Setd3Q91WC0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Setd3Q91WC0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Setd3Q91WC0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Setd3Q91WC0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Setd3Q91WC0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Setd3Q91WC0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Setd3Q91WC0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Setd3Q91WC0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Setd3Q91WC0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Setd3Q91WC0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Setd3Q91WC0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Setd3Q91WC0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Setd3Q91WC0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Setd3Q91WC0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Setd3Q91WC0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Setd3Q91WC0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Setd3Q91WC0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Setd3Q91WC0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Setd3Q91WC0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Setd3Q91WC0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Setd3Q91WC0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Setd3Q91WC0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Setd3Q91WC0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Setd3Q91WC0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Setd3Q91WC0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Setd3Q91WC0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Setd3Q91WC0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Setd3Q91WC0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Setd3Q91WC0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Setd3Q91WC0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Setd3Q91WC0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Setd3Q91WC0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Setd3Q91WC0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Setd3Q91WC0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Setd3Q91WC0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Setd3Q91WC0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Setd3Q91WC0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Setd3Q91WC0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Setd3Q91WC0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Setd3Q91WC0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Setd3Q91WC0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Setd3Q91WC0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Setd3Q91WC0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Setd3Q91WC0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Setd3Q91WC0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Setd3Q91WC0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Setd3Q91WC0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms