Protein–RNA interactions for Protein: Q91WA3

Hdac11, Histone deacetylase 11, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac11Q91WA3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac11Q91WA3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac11Q91WA3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac11Q91WA3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hdac11Q91WA3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hdac11Q91WA3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac11Q91WA3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac11Q91WA3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac11Q91WA3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac11Q91WA3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac11Q91WA3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac11Q91WA3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac11Q91WA3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac11Q91WA3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac11Q91WA3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac11Q91WA3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac11Q91WA3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac11Q91WA3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac11Q91WA3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac11Q91WA3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac11Q91WA3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac11Q91WA3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac11Q91WA3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac11Q91WA3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac11Q91WA3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac11Q91WA3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac11Q91WA3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac11Q91WA3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac11Q91WA3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac11Q91WA3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac11Q91WA3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac11Q91WA3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac11Q91WA3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac11Q91WA3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac11Q91WA3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac11Q91WA3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac11Q91WA3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac11Q91WA3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac11Q91WA3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac11Q91WA3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac11Q91WA3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac11Q91WA3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac11Q91WA3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac11Q91WA3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac11Q91WA3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac11Q91WA3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac11Q91WA3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac11Q91WA3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac11Q91WA3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac11Q91WA3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac11Q91WA3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac11Q91WA3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac11Q91WA3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac11Q91WA3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac11Q91WA3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac11Q91WA3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac11Q91WA3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac11Q91WA3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac11Q91WA3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac11Q91WA3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac11Q91WA3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac11Q91WA3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac11Q91WA3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac11Q91WA3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac11Q91WA3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac11Q91WA3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac11Q91WA3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac11Q91WA3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac11Q91WA3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac11Q91WA3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac11Q91WA3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac11Q91WA3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac11Q91WA3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac11Q91WA3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac11Q91WA3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac11Q91WA3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hdac11Q91WA3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hdac11Q91WA3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hdac11Q91WA3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hdac11Q91WA3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hdac11Q91WA3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdac11Q91WA3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdac11Q91WA3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdac11Q91WA3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac11Q91WA3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac11Q91WA3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac11Q91WA3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac11Q91WA3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac11Q91WA3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac11Q91WA3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac11Q91WA3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac11Q91WA3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac11Q91WA3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac11Q91WA3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac11Q91WA3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac11Q91WA3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac11Q91WA3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac11Q91WA3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac11Q91WA3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac11Q91WA3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms