Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW9

Zkscan3, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan3Q91VW9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zkscan3Q91VW9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Zkscan3Q91VW9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zkscan3Q91VW9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zkscan3Q91VW9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zkscan3Q91VW9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zkscan3Q91VW9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zkscan3Q91VW9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zkscan3Q91VW9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zkscan3Q91VW9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zkscan3Q91VW9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zkscan3Q91VW9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zkscan3Q91VW9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zkscan3Q91VW9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zkscan3Q91VW9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zkscan3Q91VW9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zkscan3Q91VW9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zkscan3Q91VW9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zkscan3Q91VW9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zkscan3Q91VW9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zkscan3Q91VW9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zkscan3Q91VW9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zkscan3Q91VW9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zkscan3Q91VW9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zkscan3Q91VW9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zkscan3Q91VW9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zkscan3Q91VW9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zkscan3Q91VW9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Zkscan3Q91VW9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Zkscan3Q91VW9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zkscan3Q91VW9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Zkscan3Q91VW9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zkscan3Q91VW9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zkscan3Q91VW9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zkscan3Q91VW9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zkscan3Q91VW9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zkscan3Q91VW9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zkscan3Q91VW9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zkscan3Q91VW9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zkscan3Q91VW9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zkscan3Q91VW9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zkscan3Q91VW9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zkscan3Q91VW9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zkscan3Q91VW9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zkscan3Q91VW9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zkscan3Q91VW9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zkscan3Q91VW9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zkscan3Q91VW9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zkscan3Q91VW9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Zkscan3Q91VW9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zkscan3Q91VW9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zkscan3Q91VW9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zkscan3Q91VW9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zkscan3Q91VW9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zkscan3Q91VW9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zkscan3Q91VW9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zkscan3Q91VW9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zkscan3Q91VW9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zkscan3Q91VW9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zkscan3Q91VW9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zkscan3Q91VW9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Zkscan3Q91VW9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zkscan3Q91VW9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zkscan3Q91VW9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zkscan3Q91VW9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zkscan3Q91VW9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zkscan3Q91VW9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zkscan3Q91VW9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zkscan3Q91VW9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zkscan3Q91VW9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zkscan3Q91VW9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zkscan3Q91VW9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zkscan3Q91VW9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zkscan3Q91VW9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zkscan3Q91VW9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Zkscan3Q91VW9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zkscan3Q91VW9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zkscan3Q91VW9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zkscan3Q91VW9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zkscan3Q91VW9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zkscan3Q91VW9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zkscan3Q91VW9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zkscan3Q91VW9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zkscan3Q91VW9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zkscan3Q91VW9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zkscan3Q91VW9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zkscan3Q91VW9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zkscan3Q91VW9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zkscan3Q91VW9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zkscan3Q91VW9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zkscan3Q91VW9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zkscan3Q91VW9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zkscan3Q91VW9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zkscan3Q91VW9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zkscan3Q91VW9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zkscan3Q91VW9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zkscan3Q91VW9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zkscan3Q91VW9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zkscan3Q91VW9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zkscan3Q91VW9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms