Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ5

Mark1, Serine/threonine-protein kinase MARK1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mark1Q8VHJ5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mark1Q8VHJ5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mark1Q8VHJ5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mark1Q8VHJ5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mark1Q8VHJ5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mark1Q8VHJ5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mark1Q8VHJ5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mark1Q8VHJ5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mark1Q8VHJ5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mark1Q8VHJ5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mark1Q8VHJ5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mark1Q8VHJ5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mark1Q8VHJ5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mark1Q8VHJ5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mark1Q8VHJ5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mark1Q8VHJ5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mark1Q8VHJ5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mark1Q8VHJ5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mark1Q8VHJ5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mark1Q8VHJ5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mark1Q8VHJ5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mark1Q8VHJ5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mark1Q8VHJ5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mark1Q8VHJ5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mark1Q8VHJ5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mark1Q8VHJ5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mark1Q8VHJ5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mark1Q8VHJ5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Mark1Q8VHJ5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mark1Q8VHJ5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mark1Q8VHJ5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mark1Q8VHJ5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mark1Q8VHJ5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mark1Q8VHJ5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mark1Q8VHJ5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mark1Q8VHJ5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mark1Q8VHJ5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mark1Q8VHJ5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mark1Q8VHJ5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mark1Q8VHJ5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mark1Q8VHJ5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mark1Q8VHJ5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mark1Q8VHJ5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mark1Q8VHJ5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mark1Q8VHJ5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mark1Q8VHJ5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mark1Q8VHJ5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Mark1Q8VHJ5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mark1Q8VHJ5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mark1Q8VHJ5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mark1Q8VHJ5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mark1Q8VHJ5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mark1Q8VHJ5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mark1Q8VHJ5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Mark1Q8VHJ5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mark1Q8VHJ5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mark1Q8VHJ5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mark1Q8VHJ5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mark1Q8VHJ5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Mark1Q8VHJ5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mark1Q8VHJ5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mark1Q8VHJ5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mark1Q8VHJ5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mark1Q8VHJ5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mark1Q8VHJ5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mark1Q8VHJ5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mark1Q8VHJ5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mark1Q8VHJ5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mark1Q8VHJ5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mark1Q8VHJ5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Mark1Q8VHJ5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mark1Q8VHJ5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mark1Q8VHJ5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mark1Q8VHJ5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mark1Q8VHJ5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Mark1Q8VHJ5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mark1Q8VHJ5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Mark1Q8VHJ5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mark1Q8VHJ5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mark1Q8VHJ5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mark1Q8VHJ5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mark1Q8VHJ5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mark1Q8VHJ5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mark1Q8VHJ5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mark1Q8VHJ5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Mark1Q8VHJ5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mark1Q8VHJ5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mark1Q8VHJ5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mark1Q8VHJ5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mark1Q8VHJ5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mark1Q8VHJ5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Mark1Q8VHJ5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mark1Q8VHJ5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mark1Q8VHJ5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mark1Q8VHJ5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mark1Q8VHJ5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mark1Q8VHJ5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mark1Q8VHJ5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mark1Q8VHJ5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mark1Q8VHJ5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms