Protein–RNA interactions for Protein: Q8VH37

Hdac8, Histone deacetylase 8, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac8Q8VH37 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac8Q8VH37 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac8Q8VH37 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac8Q8VH37 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac8Q8VH37 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac8Q8VH37 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac8Q8VH37 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac8Q8VH37 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac8Q8VH37 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac8Q8VH37 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac8Q8VH37 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac8Q8VH37 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac8Q8VH37 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac8Q8VH37 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac8Q8VH37 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac8Q8VH37 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac8Q8VH37 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac8Q8VH37 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac8Q8VH37 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hdac8Q8VH37 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hdac8Q8VH37 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdac8Q8VH37 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdac8Q8VH37 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdac8Q8VH37 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdac8Q8VH37 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdac8Q8VH37 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdac8Q8VH37 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac8Q8VH37 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac8Q8VH37 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac8Q8VH37 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac8Q8VH37 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac8Q8VH37 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac8Q8VH37 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac8Q8VH37 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac8Q8VH37 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac8Q8VH37 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac8Q8VH37 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac8Q8VH37 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac8Q8VH37 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac8Q8VH37 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac8Q8VH37 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac8Q8VH37 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac8Q8VH37 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac8Q8VH37 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac8Q8VH37 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac8Q8VH37 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac8Q8VH37 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac8Q8VH37 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac8Q8VH37 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac8Q8VH37 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac8Q8VH37 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac8Q8VH37 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac8Q8VH37 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac8Q8VH37 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac8Q8VH37 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac8Q8VH37 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac8Q8VH37 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac8Q8VH37 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac8Q8VH37 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac8Q8VH37 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac8Q8VH37 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac8Q8VH37 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac8Q8VH37 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hdac8Q8VH37 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hdac8Q8VH37 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac8Q8VH37 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac8Q8VH37 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac8Q8VH37 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac8Q8VH37 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac8Q8VH37 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac8Q8VH37 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac8Q8VH37 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac8Q8VH37 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac8Q8VH37 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac8Q8VH37 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac8Q8VH37 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac8Q8VH37 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hdac8Q8VH37 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hdac8Q8VH37 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hdac8Q8VH37 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hdac8Q8VH37 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hdac8Q8VH37 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hdac8Q8VH37 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hdac8Q8VH37 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hdac8Q8VH37 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hdac8Q8VH37 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Hdac8Q8VH37 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hdac8Q8VH37 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hdac8Q8VH37 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hdac8Q8VH37 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hdac8Q8VH37 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hdac8Q8VH37 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hdac8Q8VH37 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hdac8Q8VH37 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Hdac8Q8VH37 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Hdac8Q8VH37 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hdac8Q8VH37 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hdac8Q8VH37 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hdac8Q8VH37 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hdac8Q8VH37 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms