Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEF1

Gramd1a, GRAM domain-containing protein 1A, mousemouse

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Length 722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd1aQ8VEF1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gramd1aQ8VEF1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gramd1aQ8VEF1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gramd1aQ8VEF1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gramd1aQ8VEF1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gramd1aQ8VEF1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gramd1aQ8VEF1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gramd1aQ8VEF1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gramd1aQ8VEF1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gramd1aQ8VEF1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gramd1aQ8VEF1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gramd1aQ8VEF1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gramd1aQ8VEF1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gramd1aQ8VEF1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gramd1aQ8VEF1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gramd1aQ8VEF1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gramd1aQ8VEF1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gramd1aQ8VEF1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gramd1aQ8VEF1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gramd1aQ8VEF1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gramd1aQ8VEF1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gramd1aQ8VEF1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gramd1aQ8VEF1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gramd1aQ8VEF1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gramd1aQ8VEF1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gramd1aQ8VEF1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gramd1aQ8VEF1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gramd1aQ8VEF1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gramd1aQ8VEF1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gramd1aQ8VEF1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gramd1aQ8VEF1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gramd1aQ8VEF1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gramd1aQ8VEF1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gramd1aQ8VEF1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gramd1aQ8VEF1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gramd1aQ8VEF1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gramd1aQ8VEF1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gramd1aQ8VEF1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gramd1aQ8VEF1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gramd1aQ8VEF1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gramd1aQ8VEF1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gramd1aQ8VEF1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gramd1aQ8VEF1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gramd1aQ8VEF1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gramd1aQ8VEF1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gramd1aQ8VEF1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gramd1aQ8VEF1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gramd1aQ8VEF1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gramd1aQ8VEF1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gramd1aQ8VEF1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gramd1aQ8VEF1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gramd1aQ8VEF1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gramd1aQ8VEF1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gramd1aQ8VEF1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gramd1aQ8VEF1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gramd1aQ8VEF1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gramd1aQ8VEF1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gramd1aQ8VEF1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gramd1aQ8VEF1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gramd1aQ8VEF1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gramd1aQ8VEF1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gramd1aQ8VEF1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gramd1aQ8VEF1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gramd1aQ8VEF1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gramd1aQ8VEF1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gramd1aQ8VEF1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gramd1aQ8VEF1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gramd1aQ8VEF1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gramd1aQ8VEF1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gramd1aQ8VEF1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gramd1aQ8VEF1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gramd1aQ8VEF1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gramd1aQ8VEF1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gramd1aQ8VEF1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gramd1aQ8VEF1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gramd1aQ8VEF1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gramd1aQ8VEF1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gramd1aQ8VEF1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gramd1aQ8VEF1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gramd1aQ8VEF1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gramd1aQ8VEF1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gramd1aQ8VEF1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gramd1aQ8VEF1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gramd1aQ8VEF1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gramd1aQ8VEF1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gramd1aQ8VEF1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gramd1aQ8VEF1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gramd1aQ8VEF1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gramd1aQ8VEF1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gramd1aQ8VEF1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gramd1aQ8VEF1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gramd1aQ8VEF1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gramd1aQ8VEF1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gramd1aQ8VEF1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gramd1aQ8VEF1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gramd1aQ8VEF1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gramd1aQ8VEF1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gramd1aQ8VEF1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gramd1aQ8VEF1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gramd1aQ8VEF1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms