Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rprd1aQ8VDS4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rprd1aQ8VDS4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rprd1aQ8VDS4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rprd1aQ8VDS4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rprd1aQ8VDS4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rprd1aQ8VDS4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rprd1aQ8VDS4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rprd1aQ8VDS4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rprd1aQ8VDS4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rprd1aQ8VDS4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rprd1aQ8VDS4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rprd1aQ8VDS4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rprd1aQ8VDS4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rprd1aQ8VDS4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rprd1aQ8VDS4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rprd1aQ8VDS4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rprd1aQ8VDS4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rprd1aQ8VDS4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rprd1aQ8VDS4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rprd1aQ8VDS4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Rprd1aQ8VDS4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rprd1aQ8VDS4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rprd1aQ8VDS4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rprd1aQ8VDS4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rprd1aQ8VDS4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rprd1aQ8VDS4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rprd1aQ8VDS4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rprd1aQ8VDS4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rprd1aQ8VDS4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rprd1aQ8VDS4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rprd1aQ8VDS4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rprd1aQ8VDS4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rprd1aQ8VDS4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rprd1aQ8VDS4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rprd1aQ8VDS4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rprd1aQ8VDS4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rprd1aQ8VDS4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rprd1aQ8VDS4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rprd1aQ8VDS4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rprd1aQ8VDS4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rprd1aQ8VDS4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rprd1aQ8VDS4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rprd1aQ8VDS4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rprd1aQ8VDS4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rprd1aQ8VDS4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rprd1aQ8VDS4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rprd1aQ8VDS4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rprd1aQ8VDS4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rprd1aQ8VDS4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rprd1aQ8VDS4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rprd1aQ8VDS4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rprd1aQ8VDS4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rprd1aQ8VDS4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rprd1aQ8VDS4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rprd1aQ8VDS4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rprd1aQ8VDS4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rprd1aQ8VDS4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rprd1aQ8VDS4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rprd1aQ8VDS4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rprd1aQ8VDS4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rprd1aQ8VDS4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rprd1aQ8VDS4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rprd1aQ8VDS4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rprd1aQ8VDS4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rprd1aQ8VDS4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rprd1aQ8VDS4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rprd1aQ8VDS4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rprd1aQ8VDS4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rprd1aQ8VDS4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rprd1aQ8VDS4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rprd1aQ8VDS4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rprd1aQ8VDS4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rprd1aQ8VDS4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rprd1aQ8VDS4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rprd1aQ8VDS4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rprd1aQ8VDS4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rprd1aQ8VDS4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rprd1aQ8VDS4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rprd1aQ8VDS4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rprd1aQ8VDS4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rprd1aQ8VDS4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rprd1aQ8VDS4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rprd1aQ8VDS4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rprd1aQ8VDS4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rprd1aQ8VDS4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rprd1aQ8VDS4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rprd1aQ8VDS4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rprd1aQ8VDS4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rprd1aQ8VDS4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rprd1aQ8VDS4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rprd1aQ8VDS4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rprd1aQ8VDS4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rprd1aQ8VDS4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rprd1aQ8VDS4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rprd1aQ8VDS4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rprd1aQ8VDS4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rprd1aQ8VDS4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rprd1aQ8VDS4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rprd1aQ8VDS4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms