Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dnajc28Q8VCE1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dnajc28Q8VCE1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dnajc28Q8VCE1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dnajc28Q8VCE1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dnajc28Q8VCE1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dnajc28Q8VCE1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dnajc28Q8VCE1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dnajc28Q8VCE1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Dnajc28Q8VCE1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dnajc28Q8VCE1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnajc28Q8VCE1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnajc28Q8VCE1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnajc28Q8VCE1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnajc28Q8VCE1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnajc28Q8VCE1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnajc28Q8VCE1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnajc28Q8VCE1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnajc28Q8VCE1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnajc28Q8VCE1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnajc28Q8VCE1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnajc28Q8VCE1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnajc28Q8VCE1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnajc28Q8VCE1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnajc28Q8VCE1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dnajc28Q8VCE1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dnajc28Q8VCE1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dnajc28Q8VCE1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dnajc28Q8VCE1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Dnajc28Q8VCE1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Dnajc28Q8VCE1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dnajc28Q8VCE1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dnajc28Q8VCE1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dnajc28Q8VCE1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dnajc28Q8VCE1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dnajc28Q8VCE1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dnajc28Q8VCE1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dnajc28Q8VCE1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Dnajc28Q8VCE1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dnajc28Q8VCE1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnajc28Q8VCE1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnajc28Q8VCE1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnajc28Q8VCE1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnajc28Q8VCE1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnajc28Q8VCE1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnajc28Q8VCE1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnajc28Q8VCE1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnajc28Q8VCE1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dnajc28Q8VCE1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dnajc28Q8VCE1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dnajc28Q8VCE1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dnajc28Q8VCE1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dnajc28Q8VCE1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dnajc28Q8VCE1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dnajc28Q8VCE1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dnajc28Q8VCE1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dnajc28Q8VCE1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dnajc28Q8VCE1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dnajc28Q8VCE1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dnajc28Q8VCE1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dnajc28Q8VCE1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dnajc28Q8VCE1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dnajc28Q8VCE1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dnajc28Q8VCE1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dnajc28Q8VCE1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dnajc28Q8VCE1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Dnajc28Q8VCE1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dnajc28Q8VCE1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Dnajc28Q8VCE1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnajc28Q8VCE1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnajc28Q8VCE1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnajc28Q8VCE1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnajc28Q8VCE1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnajc28Q8VCE1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnajc28Q8VCE1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnajc28Q8VCE1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnajc28Q8VCE1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnajc28Q8VCE1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnajc28Q8VCE1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnajc28Q8VCE1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnajc28Q8VCE1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnajc28Q8VCE1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnajc28Q8VCE1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnajc28Q8VCE1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnajc28Q8VCE1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnajc28Q8VCE1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnajc28Q8VCE1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnajc28Q8VCE1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnajc28Q8VCE1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnajc28Q8VCE1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dnajc28Q8VCE1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dnajc28Q8VCE1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dnajc28Q8VCE1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dnajc28Q8VCE1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dnajc28Q8VCE1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dnajc28Q8VCE1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dnajc28Q8VCE1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dnajc28Q8VCE1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dnajc28Q8VCE1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Dnajc28Q8VCE1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms