Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD7

Kdm4c, Lysine-specific demethylase 4C, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4cQ8VCD7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kdm4cQ8VCD7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kdm4cQ8VCD7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kdm4cQ8VCD7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kdm4cQ8VCD7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kdm4cQ8VCD7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kdm4cQ8VCD7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kdm4cQ8VCD7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kdm4cQ8VCD7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kdm4cQ8VCD7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kdm4cQ8VCD7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kdm4cQ8VCD7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kdm4cQ8VCD7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kdm4cQ8VCD7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kdm4cQ8VCD7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kdm4cQ8VCD7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kdm4cQ8VCD7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kdm4cQ8VCD7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kdm4cQ8VCD7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kdm4cQ8VCD7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kdm4cQ8VCD7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kdm4cQ8VCD7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kdm4cQ8VCD7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kdm4cQ8VCD7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kdm4cQ8VCD7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kdm4cQ8VCD7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kdm4cQ8VCD7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kdm4cQ8VCD7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kdm4cQ8VCD7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kdm4cQ8VCD7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kdm4cQ8VCD7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Kdm4cQ8VCD7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Kdm4cQ8VCD7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kdm4cQ8VCD7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kdm4cQ8VCD7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kdm4cQ8VCD7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kdm4cQ8VCD7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kdm4cQ8VCD7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kdm4cQ8VCD7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kdm4cQ8VCD7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kdm4cQ8VCD7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kdm4cQ8VCD7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Kdm4cQ8VCD7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kdm4cQ8VCD7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kdm4cQ8VCD7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kdm4cQ8VCD7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kdm4cQ8VCD7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kdm4cQ8VCD7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kdm4cQ8VCD7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kdm4cQ8VCD7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Kdm4cQ8VCD7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kdm4cQ8VCD7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kdm4cQ8VCD7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kdm4cQ8VCD7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kdm4cQ8VCD7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kdm4cQ8VCD7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kdm4cQ8VCD7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kdm4cQ8VCD7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kdm4cQ8VCD7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kdm4cQ8VCD7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Kdm4cQ8VCD7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Kdm4cQ8VCD7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Kdm4cQ8VCD7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kdm4cQ8VCD7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kdm4cQ8VCD7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kdm4cQ8VCD7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kdm4cQ8VCD7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kdm4cQ8VCD7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kdm4cQ8VCD7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kdm4cQ8VCD7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kdm4cQ8VCD7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kdm4cQ8VCD7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Kdm4cQ8VCD7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kdm4cQ8VCD7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kdm4cQ8VCD7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kdm4cQ8VCD7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kdm4cQ8VCD7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kdm4cQ8VCD7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kdm4cQ8VCD7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kdm4cQ8VCD7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kdm4cQ8VCD7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kdm4cQ8VCD7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kdm4cQ8VCD7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Kdm4cQ8VCD7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Kdm4cQ8VCD7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Kdm4cQ8VCD7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Kdm4cQ8VCD7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Kdm4cQ8VCD7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Kdm4cQ8VCD7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Kdm4cQ8VCD7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Kdm4cQ8VCD7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Kdm4cQ8VCD7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm4cQ8VCD7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm4cQ8VCD7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm4cQ8VCD7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm4cQ8VCD7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm4cQ8VCD7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm4cQ8VCD7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm4cQ8VCD7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kdm4cQ8VCD7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms