Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim29Q8R2Q0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim29Q8R2Q0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim29Q8R2Q0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim29Q8R2Q0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim29Q8R2Q0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim29Q8R2Q0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim29Q8R2Q0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim29Q8R2Q0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim29Q8R2Q0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim29Q8R2Q0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim29Q8R2Q0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim29Q8R2Q0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim29Q8R2Q0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim29Q8R2Q0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim29Q8R2Q0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim29Q8R2Q0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim29Q8R2Q0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim29Q8R2Q0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim29Q8R2Q0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim29Q8R2Q0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim29Q8R2Q0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim29Q8R2Q0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim29Q8R2Q0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim29Q8R2Q0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim29Q8R2Q0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim29Q8R2Q0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim29Q8R2Q0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim29Q8R2Q0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim29Q8R2Q0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim29Q8R2Q0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim29Q8R2Q0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim29Q8R2Q0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim29Q8R2Q0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim29Q8R2Q0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim29Q8R2Q0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim29Q8R2Q0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim29Q8R2Q0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim29Q8R2Q0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim29Q8R2Q0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim29Q8R2Q0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim29Q8R2Q0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim29Q8R2Q0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim29Q8R2Q0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim29Q8R2Q0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim29Q8R2Q0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim29Q8R2Q0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim29Q8R2Q0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim29Q8R2Q0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim29Q8R2Q0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim29Q8R2Q0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim29Q8R2Q0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trim29Q8R2Q0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim29Q8R2Q0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim29Q8R2Q0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim29Q8R2Q0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim29Q8R2Q0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim29Q8R2Q0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim29Q8R2Q0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim29Q8R2Q0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim29Q8R2Q0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim29Q8R2Q0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim29Q8R2Q0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim29Q8R2Q0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim29Q8R2Q0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim29Q8R2Q0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim29Q8R2Q0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim29Q8R2Q0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim29Q8R2Q0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim29Q8R2Q0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim29Q8R2Q0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim29Q8R2Q0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim29Q8R2Q0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim29Q8R2Q0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim29Q8R2Q0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim29Q8R2Q0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim29Q8R2Q0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim29Q8R2Q0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim29Q8R2Q0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim29Q8R2Q0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim29Q8R2Q0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim29Q8R2Q0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim29Q8R2Q0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim29Q8R2Q0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim29Q8R2Q0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim29Q8R2Q0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim29Q8R2Q0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim29Q8R2Q0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim29Q8R2Q0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim29Q8R2Q0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim29Q8R2Q0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim29Q8R2Q0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim29Q8R2Q0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim29Q8R2Q0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim29Q8R2Q0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim29Q8R2Q0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim29Q8R2Q0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim29Q8R2Q0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim29Q8R2Q0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim29Q8R2Q0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms