Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0H9

Gga1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga1Q8R0H9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gga1Q8R0H9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gga1Q8R0H9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gga1Q8R0H9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gga1Q8R0H9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gga1Q8R0H9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gga1Q8R0H9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gga1Q8R0H9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gga1Q8R0H9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gga1Q8R0H9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gga1Q8R0H9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gga1Q8R0H9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gga1Q8R0H9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gga1Q8R0H9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gga1Q8R0H9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gga1Q8R0H9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gga1Q8R0H9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gga1Q8R0H9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gga1Q8R0H9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gga1Q8R0H9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gga1Q8R0H9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gga1Q8R0H9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gga1Q8R0H9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gga1Q8R0H9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gga1Q8R0H9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gga1Q8R0H9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gga1Q8R0H9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gga1Q8R0H9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gga1Q8R0H9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gga1Q8R0H9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gga1Q8R0H9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gga1Q8R0H9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gga1Q8R0H9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gga1Q8R0H9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gga1Q8R0H9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gga1Q8R0H9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gga1Q8R0H9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Gga1Q8R0H9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gga1Q8R0H9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gga1Q8R0H9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gga1Q8R0H9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gga1Q8R0H9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gga1Q8R0H9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gga1Q8R0H9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gga1Q8R0H9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gga1Q8R0H9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gga1Q8R0H9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gga1Q8R0H9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gga1Q8R0H9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gga1Q8R0H9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gga1Q8R0H9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gga1Q8R0H9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gga1Q8R0H9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gga1Q8R0H9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gga1Q8R0H9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gga1Q8R0H9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gga1Q8R0H9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gga1Q8R0H9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gga1Q8R0H9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gga1Q8R0H9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gga1Q8R0H9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gga1Q8R0H9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gga1Q8R0H9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gga1Q8R0H9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gga1Q8R0H9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gga1Q8R0H9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gga1Q8R0H9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gga1Q8R0H9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gga1Q8R0H9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gga1Q8R0H9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gga1Q8R0H9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gga1Q8R0H9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gga1Q8R0H9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gga1Q8R0H9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gga1Q8R0H9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gga1Q8R0H9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gga1Q8R0H9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gga1Q8R0H9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gga1Q8R0H9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gga1Q8R0H9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gga1Q8R0H9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gga1Q8R0H9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gga1Q8R0H9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gga1Q8R0H9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gga1Q8R0H9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gga1Q8R0H9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gga1Q8R0H9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gga1Q8R0H9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gga1Q8R0H9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gga1Q8R0H9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gga1Q8R0H9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gga1Q8R0H9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gga1Q8R0H9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gga1Q8R0H9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gga1Q8R0H9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gga1Q8R0H9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gga1Q8R0H9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gga1Q8R0H9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gga1Q8R0H9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gga1Q8R0H9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms