Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
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Rnf183Q8QZS5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Rnf183Q8QZS5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Rnf183Q8QZS5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Rnf183Q8QZS5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Rnf183Q8QZS5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Rnf183Q8QZS5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Rnf183Q8QZS5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Rnf183Q8QZS5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Rnf183Q8QZS5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Rnf183Q8QZS5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Rnf183Q8QZS5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Rnf183Q8QZS5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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