Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf183Q8QZS5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms