Protein–RNA interactions for Protein: Q8K558

Treml1, Trem-like transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml1Q8K558 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Treml1Q8K558 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Treml1Q8K558 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Treml1Q8K558 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Treml1Q8K558 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Treml1Q8K558 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Treml1Q8K558 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Treml1Q8K558 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Treml1Q8K558 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Treml1Q8K558 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Treml1Q8K558 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Treml1Q8K558 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Treml1Q8K558 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Treml1Q8K558 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Treml1Q8K558 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Treml1Q8K558 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Treml1Q8K558 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Treml1Q8K558 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Treml1Q8K558 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Treml1Q8K558 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Treml1Q8K558 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Treml1Q8K558 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Treml1Q8K558 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Treml1Q8K558 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Treml1Q8K558 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Treml1Q8K558 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Treml1Q8K558 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Treml1Q8K558 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Treml1Q8K558 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Treml1Q8K558 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Treml1Q8K558 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Treml1Q8K558 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Treml1Q8K558 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Treml1Q8K558 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Treml1Q8K558 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Treml1Q8K558 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Treml1Q8K558 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Treml1Q8K558 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Treml1Q8K558 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Treml1Q8K558 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Treml1Q8K558 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Treml1Q8K558 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Treml1Q8K558 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Treml1Q8K558 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Treml1Q8K558 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Treml1Q8K558 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Treml1Q8K558 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Treml1Q8K558 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Treml1Q8K558 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Treml1Q8K558 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Treml1Q8K558 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Treml1Q8K558 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Treml1Q8K558 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Treml1Q8K558 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Treml1Q8K558 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Treml1Q8K558 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Treml1Q8K558 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Treml1Q8K558 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Treml1Q8K558 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Treml1Q8K558 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Treml1Q8K558 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Treml1Q8K558 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Treml1Q8K558 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Treml1Q8K558 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Treml1Q8K558 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Treml1Q8K558 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Treml1Q8K558 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Treml1Q8K558 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Treml1Q8K558 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Treml1Q8K558 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Treml1Q8K558 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Treml1Q8K558 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Treml1Q8K558 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Treml1Q8K558 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Treml1Q8K558 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Treml1Q8K558 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Treml1Q8K558 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Treml1Q8K558 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Treml1Q8K558 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Treml1Q8K558 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Treml1Q8K558 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Treml1Q8K558 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Treml1Q8K558 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Treml1Q8K558 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Treml1Q8K558 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Treml1Q8K558 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Treml1Q8K558 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Treml1Q8K558 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Treml1Q8K558 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Treml1Q8K558 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Treml1Q8K558 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Treml1Q8K558 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Treml1Q8K558 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Treml1Q8K558 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Treml1Q8K558 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Treml1Q8K558 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Treml1Q8K558 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Treml1Q8K558 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Treml1Q8K558 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Treml1Q8K558 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms