Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3J1

Ndufs8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs8Q8K3J1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndufs8Q8K3J1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndufs8Q8K3J1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndufs8Q8K3J1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndufs8Q8K3J1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndufs8Q8K3J1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndufs8Q8K3J1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufs8Q8K3J1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufs8Q8K3J1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufs8Q8K3J1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufs8Q8K3J1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufs8Q8K3J1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufs8Q8K3J1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufs8Q8K3J1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufs8Q8K3J1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufs8Q8K3J1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufs8Q8K3J1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufs8Q8K3J1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufs8Q8K3J1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufs8Q8K3J1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufs8Q8K3J1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufs8Q8K3J1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufs8Q8K3J1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufs8Q8K3J1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufs8Q8K3J1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndufs8Q8K3J1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ndufs8Q8K3J1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ndufs8Q8K3J1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ndufs8Q8K3J1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ndufs8Q8K3J1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ndufs8Q8K3J1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ndufs8Q8K3J1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ndufs8Q8K3J1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ndufs8Q8K3J1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ndufs8Q8K3J1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ndufs8Q8K3J1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ndufs8Q8K3J1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ndufs8Q8K3J1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ndufs8Q8K3J1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ndufs8Q8K3J1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms