Protein–RNA interactions for Protein: Q8K348

Acvr1c, Activin receptor type-1C, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1cQ8K348 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Acvr1cQ8K348 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Acvr1cQ8K348 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Acvr1cQ8K348 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Acvr1cQ8K348 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Acvr1cQ8K348 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Acvr1cQ8K348 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Acvr1cQ8K348 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Acvr1cQ8K348 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Acvr1cQ8K348 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Acvr1cQ8K348 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Acvr1cQ8K348 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Acvr1cQ8K348 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Acvr1cQ8K348 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Acvr1cQ8K348 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Acvr1cQ8K348 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Acvr1cQ8K348 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Acvr1cQ8K348 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Acvr1cQ8K348 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Acvr1cQ8K348 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Acvr1cQ8K348 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Acvr1cQ8K348 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Acvr1cQ8K348 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Acvr1cQ8K348 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Acvr1cQ8K348 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Acvr1cQ8K348 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Acvr1cQ8K348 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Acvr1cQ8K348 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Acvr1cQ8K348 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Acvr1cQ8K348 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Acvr1cQ8K348 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Acvr1cQ8K348 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Acvr1cQ8K348 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Acvr1cQ8K348 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Acvr1cQ8K348 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Acvr1cQ8K348 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Acvr1cQ8K348 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Acvr1cQ8K348 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Acvr1cQ8K348 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Acvr1cQ8K348 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Acvr1cQ8K348 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Acvr1cQ8K348 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Acvr1cQ8K348 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Acvr1cQ8K348 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Acvr1cQ8K348 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Acvr1cQ8K348 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Acvr1cQ8K348 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Acvr1cQ8K348 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Acvr1cQ8K348 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Acvr1cQ8K348 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Acvr1cQ8K348 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Acvr1cQ8K348 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Acvr1cQ8K348 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Acvr1cQ8K348 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Acvr1cQ8K348 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Acvr1cQ8K348 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Acvr1cQ8K348 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Acvr1cQ8K348 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Acvr1cQ8K348 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Acvr1cQ8K348 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Acvr1cQ8K348 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Acvr1cQ8K348 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Acvr1cQ8K348 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Acvr1cQ8K348 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Acvr1cQ8K348 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Acvr1cQ8K348 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Acvr1cQ8K348 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Acvr1cQ8K348 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Acvr1cQ8K348 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Acvr1cQ8K348 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Acvr1cQ8K348 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Acvr1cQ8K348 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Acvr1cQ8K348 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Acvr1cQ8K348 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Acvr1cQ8K348 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Acvr1cQ8K348 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Acvr1cQ8K348 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Acvr1cQ8K348 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Acvr1cQ8K348 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Acvr1cQ8K348 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Acvr1cQ8K348 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Acvr1cQ8K348 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Acvr1cQ8K348 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Acvr1cQ8K348 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Acvr1cQ8K348 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Acvr1cQ8K348 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Acvr1cQ8K348 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Acvr1cQ8K348 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Acvr1cQ8K348 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Acvr1cQ8K348 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Acvr1cQ8K348 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Acvr1cQ8K348 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Acvr1cQ8K348 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Acvr1cQ8K348 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Acvr1cQ8K348 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Acvr1cQ8K348 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Acvr1cQ8K348 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Acvr1cQ8K348 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Acvr1cQ8K348 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Acvr1cQ8K348 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms