Protein–RNA interactions for Protein: Q8K310

Matr3, Matrin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matr3Q8K310 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Matr3Q8K310 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Matr3Q8K310 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Matr3Q8K310 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Matr3Q8K310 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Matr3Q8K310 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Matr3Q8K310 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Matr3Q8K310 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Matr3Q8K310 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Matr3Q8K310 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Matr3Q8K310 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Matr3Q8K310 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Matr3Q8K310 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Matr3Q8K310 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Matr3Q8K310 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Matr3Q8K310 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Matr3Q8K310 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Matr3Q8K310 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Matr3Q8K310 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Matr3Q8K310 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Matr3Q8K310 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Matr3Q8K310 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Matr3Q8K310 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Matr3Q8K310 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Matr3Q8K310 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Matr3Q8K310 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Matr3Q8K310 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Matr3Q8K310 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Matr3Q8K310 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Matr3Q8K310 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Matr3Q8K310 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Matr3Q8K310 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Matr3Q8K310 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Matr3Q8K310 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Matr3Q8K310 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Matr3Q8K310 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Matr3Q8K310 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Matr3Q8K310 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Matr3Q8K310 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Matr3Q8K310 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Matr3Q8K310 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Matr3Q8K310 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Matr3Q8K310 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Matr3Q8K310 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Matr3Q8K310 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Matr3Q8K310 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Matr3Q8K310 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Matr3Q8K310 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Matr3Q8K310 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Matr3Q8K310 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Matr3Q8K310 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Matr3Q8K310 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Matr3Q8K310 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Matr3Q8K310 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Matr3Q8K310 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Matr3Q8K310 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Matr3Q8K310 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Matr3Q8K310 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Matr3Q8K310 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Matr3Q8K310 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Matr3Q8K310 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Matr3Q8K310 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Matr3Q8K310 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Matr3Q8K310 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Matr3Q8K310 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Matr3Q8K310 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Matr3Q8K310 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Matr3Q8K310 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Matr3Q8K310 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Matr3Q8K310 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Matr3Q8K310 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Matr3Q8K310 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Matr3Q8K310 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Matr3Q8K310 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Matr3Q8K310 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Matr3Q8K310 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Matr3Q8K310 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Matr3Q8K310 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Matr3Q8K310 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Matr3Q8K310 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Matr3Q8K310 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Matr3Q8K310 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Matr3Q8K310 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Matr3Q8K310 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Matr3Q8K310 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Matr3Q8K310 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Matr3Q8K310 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Matr3Q8K310 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Matr3Q8K310 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Matr3Q8K310 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Matr3Q8K310 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Matr3Q8K310 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Matr3Q8K310 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Matr3Q8K310 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Matr3Q8K310 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Matr3Q8K310 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Matr3Q8K310 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Matr3Q8K310 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Matr3Q8K310 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Matr3Q8K310 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms