Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf39Q8K2Z2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf39Q8K2Z2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf39Q8K2Z2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prpf39Q8K2Z2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prpf39Q8K2Z2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prpf39Q8K2Z2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf39Q8K2Z2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf39Q8K2Z2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf39Q8K2Z2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf39Q8K2Z2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf39Q8K2Z2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf39Q8K2Z2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prpf39Q8K2Z2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prpf39Q8K2Z2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prpf39Q8K2Z2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prpf39Q8K2Z2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf39Q8K2Z2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf39Q8K2Z2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf39Q8K2Z2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf39Q8K2Z2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf39Q8K2Z2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpf39Q8K2Z2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpf39Q8K2Z2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpf39Q8K2Z2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpf39Q8K2Z2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpf39Q8K2Z2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpf39Q8K2Z2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf39Q8K2Z2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf39Q8K2Z2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf39Q8K2Z2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf39Q8K2Z2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf39Q8K2Z2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf39Q8K2Z2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf39Q8K2Z2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf39Q8K2Z2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf39Q8K2Z2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf39Q8K2Z2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf39Q8K2Z2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf39Q8K2Z2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf39Q8K2Z2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf39Q8K2Z2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf39Q8K2Z2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prpf39Q8K2Z2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prpf39Q8K2Z2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prpf39Q8K2Z2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prpf39Q8K2Z2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Prpf39Q8K2Z2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prpf39Q8K2Z2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prpf39Q8K2Z2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prpf39Q8K2Z2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prpf39Q8K2Z2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prpf39Q8K2Z2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prpf39Q8K2Z2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms