Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y7

Mrpl47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl47Q8K2Y7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Mrpl47Q8K2Y7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Mrpl47Q8K2Y7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mrpl47Q8K2Y7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mrpl47Q8K2Y7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mrpl47Q8K2Y7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mrpl47Q8K2Y7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mrpl47Q8K2Y7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mrpl47Q8K2Y7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrpl47Q8K2Y7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrpl47Q8K2Y7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrpl47Q8K2Y7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrpl47Q8K2Y7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrpl47Q8K2Y7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrpl47Q8K2Y7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrpl47Q8K2Y7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrpl47Q8K2Y7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrpl47Q8K2Y7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrpl47Q8K2Y7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrpl47Q8K2Y7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrpl47Q8K2Y7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrpl47Q8K2Y7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrpl47Q8K2Y7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrpl47Q8K2Y7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrpl47Q8K2Y7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrpl47Q8K2Y7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrpl47Q8K2Y7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrpl47Q8K2Y7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrpl47Q8K2Y7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrpl47Q8K2Y7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrpl47Q8K2Y7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrpl47Q8K2Y7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrpl47Q8K2Y7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Mrpl47Q8K2Y7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mrpl47Q8K2Y7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mrpl47Q8K2Y7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mrpl47Q8K2Y7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mrpl47Q8K2Y7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mrpl47Q8K2Y7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mrpl47Q8K2Y7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mrpl47Q8K2Y7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mrpl47Q8K2Y7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Mrpl47Q8K2Y7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mrpl47Q8K2Y7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrpl47Q8K2Y7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrpl47Q8K2Y7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrpl47Q8K2Y7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrpl47Q8K2Y7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrpl47Q8K2Y7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl47Q8K2Y7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl47Q8K2Y7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl47Q8K2Y7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl47Q8K2Y7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl47Q8K2Y7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl47Q8K2Y7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl47Q8K2Y7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl47Q8K2Y7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl47Q8K2Y7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl47Q8K2Y7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl47Q8K2Y7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl47Q8K2Y7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl47Q8K2Y7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl47Q8K2Y7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl47Q8K2Y7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl47Q8K2Y7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl47Q8K2Y7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl47Q8K2Y7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl47Q8K2Y7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl47Q8K2Y7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl47Q8K2Y7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrpl47Q8K2Y7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrpl47Q8K2Y7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrpl47Q8K2Y7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrpl47Q8K2Y7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrpl47Q8K2Y7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrpl47Q8K2Y7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrpl47Q8K2Y7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrpl47Q8K2Y7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrpl47Q8K2Y7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrpl47Q8K2Y7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrpl47Q8K2Y7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrpl47Q8K2Y7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrpl47Q8K2Y7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrpl47Q8K2Y7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrpl47Q8K2Y7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrpl47Q8K2Y7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrpl47Q8K2Y7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl47Q8K2Y7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl47Q8K2Y7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl47Q8K2Y7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl47Q8K2Y7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl47Q8K2Y7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl47Q8K2Y7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl47Q8K2Y7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl47Q8K2Y7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl47Q8K2Y7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl47Q8K2Y7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl47Q8K2Y7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl47Q8K2Y7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl47Q8K2Y7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms