Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X3

Stn1, CST complex subunit STN1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stn1Q8K2X3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Stn1Q8K2X3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Stn1Q8K2X3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Stn1Q8K2X3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Stn1Q8K2X3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Stn1Q8K2X3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Stn1Q8K2X3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Stn1Q8K2X3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Stn1Q8K2X3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Stn1Q8K2X3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Stn1Q8K2X3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Stn1Q8K2X3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Stn1Q8K2X3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Stn1Q8K2X3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Stn1Q8K2X3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Stn1Q8K2X3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Stn1Q8K2X3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Stn1Q8K2X3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Stn1Q8K2X3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Stn1Q8K2X3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Stn1Q8K2X3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Stn1Q8K2X3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Stn1Q8K2X3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Stn1Q8K2X3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Stn1Q8K2X3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Stn1Q8K2X3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Stn1Q8K2X3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Stn1Q8K2X3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Stn1Q8K2X3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Stn1Q8K2X3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Stn1Q8K2X3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Stn1Q8K2X3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Stn1Q8K2X3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Stn1Q8K2X3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Stn1Q8K2X3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Stn1Q8K2X3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Stn1Q8K2X3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Stn1Q8K2X3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Stn1Q8K2X3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Stn1Q8K2X3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Stn1Q8K2X3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Stn1Q8K2X3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Stn1Q8K2X3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Stn1Q8K2X3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Stn1Q8K2X3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Stn1Q8K2X3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Stn1Q8K2X3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Stn1Q8K2X3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Stn1Q8K2X3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Stn1Q8K2X3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Stn1Q8K2X3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Stn1Q8K2X3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Stn1Q8K2X3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Stn1Q8K2X3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stn1Q8K2X3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stn1Q8K2X3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Stn1Q8K2X3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Stn1Q8K2X3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Stn1Q8K2X3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Stn1Q8K2X3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Stn1Q8K2X3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Stn1Q8K2X3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Stn1Q8K2X3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Stn1Q8K2X3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Stn1Q8K2X3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Stn1Q8K2X3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Stn1Q8K2X3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Stn1Q8K2X3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Stn1Q8K2X3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Stn1Q8K2X3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Stn1Q8K2X3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Stn1Q8K2X3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Stn1Q8K2X3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Stn1Q8K2X3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Stn1Q8K2X3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Stn1Q8K2X3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Stn1Q8K2X3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Stn1Q8K2X3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Stn1Q8K2X3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Stn1Q8K2X3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Stn1Q8K2X3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Stn1Q8K2X3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Stn1Q8K2X3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Stn1Q8K2X3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Stn1Q8K2X3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Stn1Q8K2X3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Stn1Q8K2X3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Stn1Q8K2X3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Stn1Q8K2X3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Stn1Q8K2X3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Stn1Q8K2X3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Stn1Q8K2X3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Stn1Q8K2X3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Stn1Q8K2X3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Stn1Q8K2X3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Stn1Q8K2X3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Stn1Q8K2X3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Stn1Q8K2X3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Stn1Q8K2X3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Stn1Q8K2X3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 198.9 ms