Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trappc12Q8K2L8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Trappc12Q8K2L8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trappc12Q8K2L8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trappc12Q8K2L8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trappc12Q8K2L8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trappc12Q8K2L8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trappc12Q8K2L8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trappc12Q8K2L8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trappc12Q8K2L8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trappc12Q8K2L8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trappc12Q8K2L8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trappc12Q8K2L8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trappc12Q8K2L8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Trappc12Q8K2L8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trappc12Q8K2L8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trappc12Q8K2L8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trappc12Q8K2L8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trappc12Q8K2L8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trappc12Q8K2L8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trappc12Q8K2L8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trappc12Q8K2L8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trappc12Q8K2L8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Trappc12Q8K2L8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trappc12Q8K2L8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trappc12Q8K2L8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trappc12Q8K2L8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trappc12Q8K2L8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trappc12Q8K2L8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trappc12Q8K2L8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trappc12Q8K2L8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trappc12Q8K2L8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trappc12Q8K2L8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trappc12Q8K2L8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trappc12Q8K2L8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trappc12Q8K2L8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trappc12Q8K2L8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trappc12Q8K2L8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trappc12Q8K2L8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trappc12Q8K2L8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Trappc12Q8K2L8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trappc12Q8K2L8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Trappc12Q8K2L8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trappc12Q8K2L8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trappc12Q8K2L8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trappc12Q8K2L8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trappc12Q8K2L8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trappc12Q8K2L8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trappc12Q8K2L8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trappc12Q8K2L8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trappc12Q8K2L8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trappc12Q8K2L8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trappc12Q8K2L8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trappc12Q8K2L8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trappc12Q8K2L8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trappc12Q8K2L8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trappc12Q8K2L8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trappc12Q8K2L8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trappc12Q8K2L8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trappc12Q8K2L8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trappc12Q8K2L8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trappc12Q8K2L8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Trappc12Q8K2L8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Trappc12Q8K2L8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Trappc12Q8K2L8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trappc12Q8K2L8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trappc12Q8K2L8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Trappc12Q8K2L8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trappc12Q8K2L8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trappc12Q8K2L8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trappc12Q8K2L8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Trappc12Q8K2L8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trappc12Q8K2L8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Trappc12Q8K2L8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trappc12Q8K2L8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trappc12Q8K2L8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trappc12Q8K2L8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trappc12Q8K2L8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trappc12Q8K2L8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trappc12Q8K2L8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trappc12Q8K2L8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trappc12Q8K2L8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trappc12Q8K2L8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trappc12Q8K2L8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trappc12Q8K2L8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trappc12Q8K2L8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trappc12Q8K2L8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trappc12Q8K2L8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trappc12Q8K2L8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trappc12Q8K2L8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trappc12Q8K2L8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trappc12Q8K2L8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trappc12Q8K2L8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trappc12Q8K2L8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trappc12Q8K2L8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trappc12Q8K2L8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trappc12Q8K2L8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trappc12Q8K2L8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trappc12Q8K2L8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trappc12Q8K2L8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms