Protein–RNA interactions for Protein: Q8K297

Colgalt1, Procollagen galactosyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt1Q8K297 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Colgalt1Q8K297 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Colgalt1Q8K297 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Colgalt1Q8K297 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Colgalt1Q8K297 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Colgalt1Q8K297 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Colgalt1Q8K297 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Colgalt1Q8K297 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Colgalt1Q8K297 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Colgalt1Q8K297 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Colgalt1Q8K297 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Colgalt1Q8K297 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Colgalt1Q8K297 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Colgalt1Q8K297 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Colgalt1Q8K297 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Colgalt1Q8K297 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Colgalt1Q8K297 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Colgalt1Q8K297 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Colgalt1Q8K297 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Colgalt1Q8K297 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Colgalt1Q8K297 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Colgalt1Q8K297 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Colgalt1Q8K297 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Colgalt1Q8K297 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Colgalt1Q8K297 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Colgalt1Q8K297 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Colgalt1Q8K297 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Colgalt1Q8K297 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Colgalt1Q8K297 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Colgalt1Q8K297 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Colgalt1Q8K297 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Colgalt1Q8K297 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Colgalt1Q8K297 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Colgalt1Q8K297 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Colgalt1Q8K297 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Colgalt1Q8K297 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Colgalt1Q8K297 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Colgalt1Q8K297 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Colgalt1Q8K297 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Colgalt1Q8K297 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Colgalt1Q8K297 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Colgalt1Q8K297 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Colgalt1Q8K297 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Colgalt1Q8K297 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Colgalt1Q8K297 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Colgalt1Q8K297 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Colgalt1Q8K297 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Colgalt1Q8K297 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Colgalt1Q8K297 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Colgalt1Q8K297 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Colgalt1Q8K297 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Colgalt1Q8K297 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Colgalt1Q8K297 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Colgalt1Q8K297 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Colgalt1Q8K297 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Colgalt1Q8K297 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Colgalt1Q8K297 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Colgalt1Q8K297 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Colgalt1Q8K297 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Colgalt1Q8K297 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Colgalt1Q8K297 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Colgalt1Q8K297 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Colgalt1Q8K297 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Colgalt1Q8K297 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Colgalt1Q8K297 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Colgalt1Q8K297 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Colgalt1Q8K297 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Colgalt1Q8K297 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Colgalt1Q8K297 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Colgalt1Q8K297 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Colgalt1Q8K297 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Colgalt1Q8K297 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Colgalt1Q8K297 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Colgalt1Q8K297 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Colgalt1Q8K297 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Colgalt1Q8K297 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Colgalt1Q8K297 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Colgalt1Q8K297 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Colgalt1Q8K297 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Colgalt1Q8K297 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Colgalt1Q8K297 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Colgalt1Q8K297 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Colgalt1Q8K297 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Colgalt1Q8K297 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Colgalt1Q8K297 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Colgalt1Q8K297 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Colgalt1Q8K297 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Colgalt1Q8K297 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Colgalt1Q8K297 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Colgalt1Q8K297 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Colgalt1Q8K297 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Colgalt1Q8K297 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Colgalt1Q8K297 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Colgalt1Q8K297 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Colgalt1Q8K297 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Colgalt1Q8K297 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Colgalt1Q8K297 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Colgalt1Q8K297 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Colgalt1Q8K297 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Colgalt1Q8K297 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms