Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rasgef1bQ8JZL7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rasgef1bQ8JZL7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rasgef1bQ8JZL7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rasgef1bQ8JZL7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rasgef1bQ8JZL7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rasgef1bQ8JZL7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rasgef1bQ8JZL7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rasgef1bQ8JZL7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rasgef1bQ8JZL7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rasgef1bQ8JZL7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rasgef1bQ8JZL7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rasgef1bQ8JZL7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Rasgef1bQ8JZL7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rasgef1bQ8JZL7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rasgef1bQ8JZL7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rasgef1bQ8JZL7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rasgef1bQ8JZL7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rasgef1bQ8JZL7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rasgef1bQ8JZL7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rasgef1bQ8JZL7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rasgef1bQ8JZL7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rasgef1bQ8JZL7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rasgef1bQ8JZL7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rasgef1bQ8JZL7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rasgef1bQ8JZL7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rasgef1bQ8JZL7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rasgef1bQ8JZL7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rasgef1bQ8JZL7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rasgef1bQ8JZL7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rasgef1bQ8JZL7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rasgef1bQ8JZL7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rasgef1bQ8JZL7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Rasgef1bQ8JZL7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Rasgef1bQ8JZL7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rasgef1bQ8JZL7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rasgef1bQ8JZL7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rasgef1bQ8JZL7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rasgef1bQ8JZL7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rasgef1bQ8JZL7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rasgef1bQ8JZL7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rasgef1bQ8JZL7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rasgef1bQ8JZL7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rasgef1bQ8JZL7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rasgef1bQ8JZL7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rasgef1bQ8JZL7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rasgef1bQ8JZL7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rasgef1bQ8JZL7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rasgef1bQ8JZL7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rasgef1bQ8JZL7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rasgef1bQ8JZL7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rasgef1bQ8JZL7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rasgef1bQ8JZL7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rasgef1bQ8JZL7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rasgef1bQ8JZL7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rasgef1bQ8JZL7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rasgef1bQ8JZL7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rasgef1bQ8JZL7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rasgef1bQ8JZL7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rasgef1bQ8JZL7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rasgef1bQ8JZL7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rasgef1bQ8JZL7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rasgef1bQ8JZL7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rasgef1bQ8JZL7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rasgef1bQ8JZL7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rasgef1bQ8JZL7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rasgef1bQ8JZL7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rasgef1bQ8JZL7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rasgef1bQ8JZL7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rasgef1bQ8JZL7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rasgef1bQ8JZL7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rasgef1bQ8JZL7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rasgef1bQ8JZL7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rasgef1bQ8JZL7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rasgef1bQ8JZL7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rasgef1bQ8JZL7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rasgef1bQ8JZL7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rasgef1bQ8JZL7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rasgef1bQ8JZL7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rasgef1bQ8JZL7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rasgef1bQ8JZL7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rasgef1bQ8JZL7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rasgef1bQ8JZL7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rasgef1bQ8JZL7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rasgef1bQ8JZL7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rasgef1bQ8JZL7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rasgef1bQ8JZL7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rasgef1bQ8JZL7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rasgef1bQ8JZL7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rasgef1bQ8JZL7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rasgef1bQ8JZL7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rasgef1bQ8JZL7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rasgef1bQ8JZL7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rasgef1bQ8JZL7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rasgef1bQ8JZL7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rasgef1bQ8JZL7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rasgef1bQ8JZL7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rasgef1bQ8JZL7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rasgef1bQ8JZL7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rasgef1bQ8JZL7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.2 ms