Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIL4

Uncharacterized protein C1orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CIL4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q8CIL4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q8CIL4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q8CIL4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q8CIL4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q8CIL4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q8CIL4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q8CIL4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q8CIL4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Q8CIL4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Q8CIL4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q8CIL4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q8CIL4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q8CIL4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q8CIL4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q8CIL4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q8CIL4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q8CIL4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q8CIL4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Q8CIL4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q8CIL4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q8CIL4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q8CIL4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q8CIL4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Q8CIL4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Q8CIL4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q8CIL4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q8CIL4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q8CIL4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q8CIL4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Q8CIL4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q8CIL4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q8CIL4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Q8CIL4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q8CIL4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Q8CIL4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q8CIL4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q8CIL4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q8CIL4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q8CIL4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q8CIL4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q8CIL4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Q8CIL4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q8CIL4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q8CIL4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q8CIL4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q8CIL4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q8CIL4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q8CIL4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q8CIL4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q8CIL4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q8CIL4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q8CIL4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q8CIL4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q8CIL4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q8CIL4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q8CIL4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q8CIL4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q8CIL4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q8CIL4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q8CIL4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q8CIL4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q8CIL4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q8CIL4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q8CIL4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Q8CIL4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q8CIL4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q8CIL4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q8CIL4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q8CIL4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q8CIL4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q8CIL4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q8CIL4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q8CIL4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q8CIL4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Q8CIL4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q8CIL4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q8CIL4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q8CIL4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Q8CIL4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q8CIL4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q8CIL4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q8CIL4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q8CIL4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q8CIL4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q8CIL4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q8CIL4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q8CIL4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Q8CIL4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Q8CIL4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q8CIL4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q8CIL4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q8CIL4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Q8CIL4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q8CIL4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q8CIL4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q8CIL4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q8CIL4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q8CIL4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q8CIL4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 175.4 ms