Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI04

Cog3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog3Q8CI04 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cog3Q8CI04 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cog3Q8CI04 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cog3Q8CI04 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cog3Q8CI04 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cog3Q8CI04 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cog3Q8CI04 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cog3Q8CI04 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cog3Q8CI04 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cog3Q8CI04 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cog3Q8CI04 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cog3Q8CI04 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cog3Q8CI04 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cog3Q8CI04 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cog3Q8CI04 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cog3Q8CI04 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cog3Q8CI04 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cog3Q8CI04 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cog3Q8CI04 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cog3Q8CI04 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cog3Q8CI04 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cog3Q8CI04 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cog3Q8CI04 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cog3Q8CI04 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cog3Q8CI04 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cog3Q8CI04 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cog3Q8CI04 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cog3Q8CI04 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cog3Q8CI04 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cog3Q8CI04 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cog3Q8CI04 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cog3Q8CI04 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cog3Q8CI04 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cog3Q8CI04 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cog3Q8CI04 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cog3Q8CI04 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cog3Q8CI04 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cog3Q8CI04 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cog3Q8CI04 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cog3Q8CI04 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cog3Q8CI04 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cog3Q8CI04 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cog3Q8CI04 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cog3Q8CI04 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cog3Q8CI04 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cog3Q8CI04 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cog3Q8CI04 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cog3Q8CI04 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cog3Q8CI04 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cog3Q8CI04 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cog3Q8CI04 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cog3Q8CI04 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cog3Q8CI04 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cog3Q8CI04 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cog3Q8CI04 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cog3Q8CI04 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cog3Q8CI04 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cog3Q8CI04 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cog3Q8CI04 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cog3Q8CI04 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cog3Q8CI04 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cog3Q8CI04 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cog3Q8CI04 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cog3Q8CI04 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cog3Q8CI04 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cog3Q8CI04 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cog3Q8CI04 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cog3Q8CI04 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cog3Q8CI04 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cog3Q8CI04 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cog3Q8CI04 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cog3Q8CI04 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cog3Q8CI04 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cog3Q8CI04 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cog3Q8CI04 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cog3Q8CI04 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cog3Q8CI04 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cog3Q8CI04 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cog3Q8CI04 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cog3Q8CI04 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cog3Q8CI04 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cog3Q8CI04 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cog3Q8CI04 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cog3Q8CI04 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cog3Q8CI04 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cog3Q8CI04 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cog3Q8CI04 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cog3Q8CI04 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cog3Q8CI04 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cog3Q8CI04 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cog3Q8CI04 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cog3Q8CI04 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cog3Q8CI04 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cog3Q8CI04 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cog3Q8CI04 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cog3Q8CI04 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cog3Q8CI04 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cog3Q8CI04 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cog3Q8CI04 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cog3Q8CI04 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms